RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541260.5

CCDC189-204, Transcript of coiled-coil domain containing 189, human

TSL 5 BASIC

Gene CCDC189, Length 1,531 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC189-204	ENST00000541260	FABP12	A6NFH5	140 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260		H3BUX3	64 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	GABARAP	H6UMI1	98 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	RAB29	O14966	203 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	RCVRN	P35243	200 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	IL18	Q14116	193 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	C16orf87	Q6PH81	154 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	CCDC190	Q86UF4	302 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	OR52I2	Q8NH67	350 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	DUX5	Q96PT3	197 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	CHIA	Q9BZP6	476 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	GAB2	Q9UQC2	676 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	TUSC2	O75896	110 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	FCER2	P06734	321 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	RAB13	P51153	203 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	TAS2R46	P59540	309 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	CDK10	Q15131	360 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	PLA1A	Q53H76	456 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	CFHR4	Q92496	578 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	S1PR3	Q99500	378 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	KLK11	Q9UBX7	282 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	RBBP9	O75884	186 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	OR8U9	P0C7N5	309 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	OR5H8	P0DN80	308 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	ETV6	P41212	452 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	ACTB	P60709	375 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	ACTG1	P63261	375 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	OR8U1	Q8NH10	309 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	TCF19	Q9Y242	345 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CCDC189-204	ENST00000541260	TIMM23	O14925	209 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	OR3A3	P47888	321 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	REG1B	P48304	166 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	DGCR2	P98153	550 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	ZNF221	Q9UK13	617 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	RNF150	Q9ULK6	438 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260		V9GYH0	126 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260		A6NDX4	124 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	PROP1	O75360	226 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	HLA-DMA	P28067	261 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	GPR12	P47775	334 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	DYRK1A	Q13627	763 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	DRAM1	Q8N682	238 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	OR56B4	Q8NH76	319 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	GPR137B	O60478	399 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	CD1B	P29016	333 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	FCGR2C	P31995	323 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	HRH1	P35367	487 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	RFX2	P48378	723 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	EBI3	Q14213	229 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	ACTBL2	Q562R1	376 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	MOB3B	Q86TA1	216 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	NABP2	Q9BQ15	211 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	RAB18	Q9NP72	206 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	EHF	Q9NZC4	300 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	ATR	Q13535	2644 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CCDC189-204	ENST00000541260	SLC22A5	O76082	557 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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