RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540486.5

TRAPPC1-202, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC1, Length 759 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-202ENST00000540486 SFXN4Q6P4A7 337 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 OR52M1Q8NGK5 317 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 OR10R2Q8NGX6 335 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 OR9G1Q8NH87 305 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZNF596Q8TC21 504 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 ISOC1Q96CN7 298 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 VCX3AQ9NNX9 186 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 DPM3Q9P2X0 92 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 SLC31A2O15432 143 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 GNB3P16520 340 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 RANBP1P43487 201 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 NCS1P62166 190 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 HMGN3Q15651 99 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 MORN2Q502X0 79 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 PLA1AQ53H76 456 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 CT45A1Q5HYN5 189 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 IDNKQ5T6J7 187 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 SBSPONQ8IVN8 264 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 PRR18Q8N4B5 295 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZNF439Q8NDP4 499 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 CT45A3Q8NHU0 189 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 NDNFQ8TB73 568 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 ATG5Q9H1Y0 275 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 Q9N2K0 584 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 U3KQE9 123 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 A6NDX4 124 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 LEUTXA8MZ59 168 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 MFNGO00587 321 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 SPINT2O43291 252 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 SCTP09683 121 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 CD24P25063 80 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 GNG10P50151 68 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 DYNLT3P51808 116 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 VBP1P61758 197 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 CTF1Q16619 201 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 C6orf183Q5T699 404 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 LINC00311Q8N616 119 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 RAB3CQ96E17 227 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 MISP3Q96FF7 219 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 PRR25Q96S07 402 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 A0A075B6Q4 140 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 YPEL1O60688 119 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 HTD2P86397 168 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 GNMTQ14749 295 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 CDNFQ49AH0 187 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 GPR107Q5VW38 600 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 ODF3L1Q8IXM7 274 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 SETD6Q8TBK2 473 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 GALMQ96C23 342 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 YPEL2Q96QA6 119 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 SPATA2Q9UM82 520 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 TCF19Q9Y242 345 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 A0A1W2PPI3 338 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 TMEM127O75204 238 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 GABARAPO95166 117 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 GSTT2P0CG29 244 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 GSTT2BP0CG30 244 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 SERPINB10P48595 397 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC1-202ENST00000540486 THBS3P49746 956 aa6.97□□□□□ -1.29
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