RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 HRH4Q9H3N8 390 aa16.91■□□□□ 0.3
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A0G2JRQ6 117 aa16.9■□□□□ 0.3
PACSIN3-211ENST00000539589 APOC3P02656 99 aa16.9■□□□□ 0.3
PACSIN3-211ENST00000539589 MOGAT3Q86VF5 341 aa16.9■□□□□ 0.3
PACSIN3-211ENST00000539589 GCSAMQ8N6F7 178 aa16.9■□□□□ 0.3
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP1R35Q8TAP8 253 aa16.9■□□□□ 0.3
PACSIN3-211ENST00000539589 NEUROG1Q92886 237 aa16.9■□□□□ 0.3
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PACSIN3-211ENST00000539589 PARP11Q9NR21 331 aa16.9■□□□□ 0.3
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PACSIN3-211ENST00000539589 IGKV1D-39P04432 117 aa16.89■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 LPAR6P43657 344 aa16.89■□□□□ 0.29
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PACSIN3-211ENST00000539589 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
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PACSIN3-211ENST00000539589 AKR1C2P52895 323 aa16.89■□□□□ 0.29
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PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF585BQ52M93 769 aa16.89■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 TPRX1Q8N7U7 411 aa16.89■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 OR2D2Q9H210 308 aa16.89■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF150Q9ULK6 438 aa16.89■□□□□ 0.29
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PACSIN3-211ENST00000539589 SPP1P10451 314 aa16.88■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 TLE1Q04724 770 aa16.88■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 BAXQ07812 192 aa16.88■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 MSMO1Q15800 293 aa16.88■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 ITLN1Q8WWA0 313 aa16.88■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 SNX22Q96L94 193 aa16.88■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
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PACSIN3-211ENST00000539589 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa16.88■□□□□ 0.29
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PACSIN3-211ENST00000539589 LHBP01229 141 aa16.87■□□□□ 0.29
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PACSIN3-211ENST00000539589 GATA4P43694 442 aa16.87■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 EDDM3AQ14507 147 aa16.87■□□□□ 0.29
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PACSIN3-211ENST00000539589 EPG5Q9HCE0 2579 aa16.87■□□□□ 0.29
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PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM50AO95807 157 aa16.87■□□□□ 0.29
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PACSIN3-211ENST00000539589 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 F2RL1P55085 397 aa16.87■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 C4orf17Q53FE4 359 aa16.87■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM209AQ5JX71 171 aa16.87■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 RAB40CQ96S21 281 aa16.87■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 DYSFO75923 2080 aa16.86■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa16.86■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 IGKV1-5P01602 117 aa16.86■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 ADH4P08319 380 aa16.86■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 GZMHP20718 246 aa16.86■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 HTD2P86397 168 aa16.86■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 CLINT1Q14677 625 aa16.86■□□□□ 0.29
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PACSIN3-211ENST00000539589 Q6ZRG5 221 aa16.86■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 Q6ZRM9 215 aa16.86■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 ODAMA1E959 279 aa16.86■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 ZG16O60844 167 aa16.86■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 DANCRP0C864 163 aa16.86■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 RAB5CP51148 216 aa16.86■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 AKR1C1Q04828 323 aa16.86■□□□□ 0.29
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PACSIN3-211ENST00000539589 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa16.86■□□□□ 0.29
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PACSIN3-211ENST00000539589 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 IL19Q9UHD0 177 aa16.86■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa16.85■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 C15orf65H3BRN8 121 aa16.85■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 TNFSF4P23510 183 aa16.85■□□□□ 0.29
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PACSIN3-211ENST00000539589 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 DEFA5Q01523 94 aa16.85■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa16.85■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 DSCAMO60469 2012 aa16.84■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 LRBAP50851 2863 aa16.84■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 CST7O76096 145 aa16.84■□□□□ 0.29
PACSIN3-211ENST00000539589 LOXP28300 417 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
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