RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533507.5

NDUFS3-211, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, humanhuman

TSL 2

Gene NDUFS3, Length 1,769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS3-211ENST00000533507 SIRPDQ9H106 197 aa21.64■■□□□ 1.06
NDUFS3-211ENST00000533507 CR1P17927 2039 aa21.64■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 IGHV4-31P0DP07 118 aa21.64■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 KLRD1Q13241 179 aa21.64■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 AGMATQ9BSE5 352 aa21.64■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 RSRP1Q9BUV0 290 aa21.64■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 CLEC7AQ9BXN2 247 aa21.64■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa21.64■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 TRAV20A0A0B4J274 112 aa21.63■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 J3QR06 171 aa21.63■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 DHFRP00374 187 aa21.63■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 PIGPP57054 158 aa21.63■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 CMTM1Q8IZ96 169 aa21.63■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF645Q8N7E2 425 aa21.63■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF439Q8NDP4 499 aa21.63■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 CAPSLQ8WWF8 208 aa21.63■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 C1orf159Q96HA4 380 aa21.63■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 GPHA2Q96T91 129 aa21.63■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 A0A087X0M5 115 aa21.62■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 A0A1B0GX30 115 aa21.62■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 A0A1W2PRD5 423 aa21.62■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 A0A1W2PRF3 423 aa21.62■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 A0A1W2PRM7 423 aa21.62■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 GPR31O00270 319 aa21.62■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 PEX14O75381 377 aa21.62■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 BCAP31P51572 246 aa21.62■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 PRRX1P54821 245 aa21.62■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 C4orf46Q504U0 113 aa21.62■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 IFI27L2Q9H2X8 130 aa21.62■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 C7orf69Q9H7B7 122 aa21.62■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 GZMKP49863 264 aa21.61■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 PAX8Q06710 450 aa21.61■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 SVEP1Q4LDE5 3571 aa21.61■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 LHX4Q969G2 390 aa21.61■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC2A9Q9NRM0 540 aa21.61■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 ARG1P05089 322 aa21.61■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 MMP9P14780 707 aa21.61■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 S100GP29377 79 aa21.61■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 Q3ZCU0 254 aa21.61■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 LY6G6FQ5SQ64 297 aa21.61■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 DRAM1Q8N682 238 aa21.61■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 TBX15Q96SF7 602 aa21.61■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 AUP1Q9Y679 476 aa21.61■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 ITGB1BP1O14713 200 aa21.6■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 RPL39P5Q59GN2 51 aa21.6■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 CYB5R2Q6BCY4 276 aa21.6■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 CADM3Q8N126 398 aa21.6■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 SDHAF2Q9NX18 166 aa21.6■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 PIPOXQ9P0Z9 390 aa21.6■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 RAB29O14966 203 aa21.59■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 IGLV2-14P01704 120 aa21.59■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 VAMP1P23763 118 aa21.59■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa21.59■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 AKR1E2Q96JD6 320 aa21.59■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 ITPR3Q14573 2671 aa21.59■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa21.59■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC22A5O76082 557 aa21.59■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 OR4E1P0C645 316 aa21.59■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 VSIG10L2P0DP72 767 aa21.59■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 CD34P28906 385 aa21.59■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 TAS2R31P59538 309 aa21.59■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 TATDN3Q17R31 274 aa21.59■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC25A42Q86VD7 318 aa21.59■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF596Q8TC21 504 aa21.59■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 TNFRSF14Q92956 283 aa21.59■■□□□ 1.05
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 AKAP9Q99996 3911 aa21.58■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa21.58■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 GATA3P23771 443 aa21.58■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 CBX3Q13185 183 aa21.58■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 NCR3LG1Q68D85 454 aa21.58■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 BVESQ8NE79 360 aa21.58■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 TMEM230Q96A57 120 aa21.58■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 SEC22CQ9BRL7 303 aa21.58■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 RAG2P55895 527 aa21.57■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 TMEM128Q5BJH2 165 aa21.57■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 TBC1D26Q86UD7 250 aa21.57■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 SGPP2Q8IWX5 399 aa21.57■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 OR52B4Q8NGK2 314 aa21.57■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 OR51H1Q8NH63 302 aa21.57■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 FAM216AQ8WUB2 273 aa21.57■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 S1PR3Q99500 378 aa21.57■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.046e-8■■■■□ 24.8
NDUFS3-211ENST00000533507 CREBBPQ92793 2442 aa21.56■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 PPP1R1AQ13522 171 aa21.56■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 HLA-DRB5Q30154 266 aa21.56■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 ODF3L1Q8IXM7 274 aa21.56■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 LINC00311Q8N616 119 aa21.56■■□□□ 1.04
NDUFS3-211ENST00000533507 C8orf31Q8N9H6 132 aa21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms