RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF479Q96JC4 524 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 HPNP05981 417 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 GPX1P07203 203 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 AMY2BP19961 511 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 GNMTQ14749 295 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 SULF2Q8IWU5 870 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 C18orf12Q96KH6 178 aa7.24□□□□□ -1.25
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TRPS1-209ENST00000519674 MED29Q9NX70 200 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 EML6Q6ZMW3 1958 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 MS4A18H0YCH9 400 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 DNASE1L1P49184 302 aa7.23□□□□□ -1.25
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TRPS1-209ENST00000519674 Q0VG73 95 aa7.23□□□□□ -1.25
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TRPS1-209ENST00000519674 MS4A18Q3C1V0 323 aa7.23□□□□□ -1.25
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TRPS1-209ENST00000519674 LYZL2Q7Z4W2 148 aa7.23□□□□□ -1.25
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TRPS1-209ENST00000519674 OR10G3Q8NGC4 313 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 ST8SIA1Q92185 356 aa7.23□□□□□ -1.25
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TRPS1-209ENST00000519674 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa7.23□□□□□ -1.25
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TRPS1-209ENST00000519674 NPIPA5E9PKD4 350 aa7.23□□□□□ -1.25
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TRPS1-209ENST00000519674 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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TRPS1-209ENST00000519674 TMEM50BP56557 158 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 ROM1Q03395 351 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF726P1Q15940 193 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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TRPS1-209ENST00000519674 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 OR2V2Q96R30 315 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.23□□□□□ -1.25
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TRPS1-209ENST00000519674 NPIPA1Q9UND3 350 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 SDK2Q58EX2 2172 aa7.23□□□□□ -1.25
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TRPS1-209ENST00000519674 SLC25A17O43808 307 aa7.23□□□□□ -1.25
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TRPS1-209ENST00000519674 ATP5SQ99766 215 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 EMC6Q9BV81 110 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 METTL7AQ9H8H3 244 aa7.23□□□□□ -1.25
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TRPS1-209ENST00000519674 TRAPPC2LH3BP13 241 aa7.22□□□□□ -1.25
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TRPS1-209ENST00000519674 SLC22A24Q8N4F4 322 aa7.22□□□□□ -1.25
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TRPS1-209ENST00000519674 AZU1P20160 251 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 OR52N5Q8NH56 324 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 NRN1Q9NPD7 142 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.22□□□□□ -1.25
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