RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 TRGC1P0CF51 173 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 CEACAM1P13688 526 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM50BP56557 158 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 UBE2KP61086 200 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 RAB31Q13636 194 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 RTL6Q6ICC9 239 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 MDS2Q8NDY4 140 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 EXPH5Q8NEV8 1989 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 AGFG2O95081 481 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 PTGER4P35408 488 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 C10orf35Q96D05 121 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 POM121L2Q96KW2 1035 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 VAX2Q9UIW0 290 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 MED13LQ71F56 2210 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 RNF212BA8MTL3 300 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 PROB1E7EW31 1015 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 CORTO00230 105 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 LRP3O75074 770 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 BMP5P22003 454 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 CRYGSP22914 178 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 S100GP29377 79 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 CCKARP32238 428 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 NAAAQ02083 359 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 MST1LQ2TV78 715 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 DCAF12L2Q5VW00 463 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 DTX1Q86Y01 620 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 FAM219AQ8IW50 185 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 UBALD1Q8TB05 177 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 DCUN1D4Q92564 292 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 WDYHV1Q96HA8 205 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 OR2V2Q96R30 315 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 PROCRQ9UNN8 238 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 VSIG4Q9Y279 399 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 MED12LQ86YW9 2145 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 MGAQ8IWI9 3026 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 FAM157AC9JC47 383 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 NDUFB8O95169 186 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 TRGC2P03986 189 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 OR5G3P0C626 314 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 SLC25A4P12235 298 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 OR10J1P30954 320 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 FCGR2CP31995 323 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 NPBWR2P48146 333 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 PIP4P1Q86T03 277 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM45BQ96B21 275 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 MUCL1Q96DR8 90 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF488Q96MN9 340 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 MEMO1Q9Y316 297 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 COX11Q9Y6N1 276 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 ADAMTS20P59510 1910 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 RNF222A6NCQ9 220 aa6.71□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.71□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 PPP5D1E7EU14 171 aa6.71□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 TSPAN15O95858 294 aa6.71□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 FCGR3AP08637 254 aa6.71□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 FUT3P21217 361 aa6.71□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 CCL1P22362 96 aa6.71□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 FPR2P25090 351 aa6.71□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.71□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 CALHM1Q8IU99 346 aa6.71□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 C17orf78Q8N4C9 275 aa6.71□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.71□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 AK3Q9UIJ7 227 aa6.71□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0A6YYD4 124 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1B0GW15 77 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF728P0DKX0 622 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 GNG3P63215 75 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 SP6Q3SY56 376 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa6.71□□□□□ -1.34
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