RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512813.5

CLCN3-208, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLCN3, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-208ENST00000512813 SPINT2O43291 252 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 IFNA5P01569 189 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 OR9G9P0C7N8 305 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 HCCSP53701 268 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 CRISP1P54107 249 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 SMIM11AP58511 58 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 IL13RA2Q14627 380 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 OR5D18Q8NGL1 313 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 OTULINQ96BN8 352 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 C10orf35Q96D05 121 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 C7orf34Q96L11 122 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 H0YJW9 148 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 PRODHO43272 600 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 SYT7O43581 403 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 GALP22466 123 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 MC5RP33032 325 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 ARL3P36405 182 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 IFFO1Q0D2I5 559 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 MICAQ29983 383 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 C15orf32Q32M92 178 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 MORN2Q502X0 79 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 ELP2Q6IA86 826 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 UTS2BQ765I0 119 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 NECAP1Q8NC96 275 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 CCDC107Q8WV48 283 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 SPSB1Q96BD6 273 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 OPALINQ96PE5 141 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 NEK6Q9HC98 313 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 ENOPH1Q9UHY7 261 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 IKZF2Q9UKS7 526 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-208ENST00000512813 H3BNX3 289 aa6.58□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 H7C2Y5 167 aa6.58□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 GMNNO75496 209 aa6.58□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 NPPAP01160 153 aa6.58□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 PRH1P02810 166 aa6.58□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 APELAP0DMC3 54 aa6.58□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 DBTP11182 482 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 MYOD1P15172 320 aa6.58□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 ATF1P18846 271 aa6.58□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 RIPK1Q13546 671 aa6.58□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.58□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.58□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 TTC32Q5I0X7 151 aa6.58□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 SLC25A30Q5SVS4 291 aa6.58□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.58□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.58□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.58□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 ING4Q9UNL4 249 aa6.58□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 GAS8-AS1O95177 125 aa6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 HBZP02008 142 aa6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 CT45A6P0DMU7 189 aa6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 CT45A5P0DMU8 189 aa6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 CT45A7P0DMV0 189 aa6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 DLK1P80370 383 aa6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 GNMTQ14749 295 aa6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 ODF4Q2M2E3 257 aa6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 IFT22Q9H7X7 185 aa6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 ARMC1Q9NVT9 282 aa6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 ZNF221Q9UK13 617 aa6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.57□□□□□ -1.36
CLCN3-208ENST00000512813 AIPO00170 330 aa6.56□□□□□ -1.36
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