RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 COL6A5A8TX70 2615 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A1B0GUS0 222 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 TIMM23O14925 209 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 NDUFA7O95182 113 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 HLA-DQB1P01920 261 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 RAB13P51153 203 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 CAPSLQ8WWF8 208 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF221Q9UK13 617 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 A3GALT2U3KPV4 340 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 CD1BP29016 333 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 MOB3BQ86TA1 216 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 DRAM1Q8N682 238 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 OR4F5Q8NH21 305 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 MCFD2Q8NI22 146 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 AGMATQ9BSE5 352 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 ST8SIA5O15466 376 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 ODF3L1Q8IXM7 274 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 OR56B4Q8NH76 319 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 CFHR4Q92496 578 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 NECAP2Q9NVZ3 263 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 GAB2Q9UQC2 676 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 M0QZK8 103 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 CTDSP2O14595 271 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 REG1BP48304 166 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 COMPP49747 757 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 GPX8Q8TED1 209 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 MDFIQ99750 246 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 MMP27Q9H306 513 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 C1RLQ9NZP8 487 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 ANAPC10Q9UM13 185 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 OR2F2O95006 317 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 GPR12P47775 334 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 RAG2P55895 527 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 TAS2R46P59540 309 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 SNX29P2Q8IUI4 249 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 LAX1Q8IWV1 398 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 GVQW1Q8N7I0 195 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 OR5AP2Q8NGF4 316 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 OR4C13Q8NGP0 309 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 MIXL1Q9H2W2 232 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-212ENST00000508338 TSPAN9O75954 239 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC22A5O76082 557 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 PTHLHP12272 177 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 NAT1P18440 290 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 EBI3Q14213 229 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 HES1Q14469 280 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 OR2T10Q8NGZ9 312 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 DIRAS2Q96HU8 199 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 BEX1Q9HBH7 125 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 MMP24Q9Y5R2 645 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 RCVRNP35243 200 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 SPATA3Q8NHX4 192 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 OR2W1Q9Y3N9 320 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 OR8U9P0C7N5 309 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM11P17152 192 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 OR3A3P47888 321 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 LSAMPQ13449 338 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 CDK10Q15131 360 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 PYHIN1Q6K0P9 492 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM219Q86XT9 240 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 OR8H1Q8NGG4 311 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 OR8U1Q8NH10 309 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 SNAPC3Q92966 411 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 ABHD14BQ96IU4 210 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC25A33Q9BSK2 321 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 C16orf95Q9H693 158 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 DPPA5A6NC42 116 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 CHST1O43916 411 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 MOSP00540 346 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 IGKV1D-33P01593 117 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 IGKV1-33P01594 117 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 MC5RP33032 325 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 S100A5P33763 92 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 LUMP51884 338 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 ACTBP60709 375 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 C11orf88Q6PI97 169 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 NABP2Q9BQ15 211 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF251Q9BRH9 671 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-212ENST00000508338 OR2D2Q9H210 308 aa21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms