RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497221.1

DUSP28-205, Transcript of dual specificity phosphatase 28, human

TSL 2

Gene DUSP28, Length 488 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DUSP28-205	ENST00000497221	AKAP14	Q86UN6	197 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	TMEM104	Q8NE00	496 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	UFD1	Q92890	307 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221		A0A1W2PPI3	338 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	PSMB11	A5LHX3	300 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	SERPINE3	A8MV23	424 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	FAM25A	B3EWG3	89 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	FAM25C	B3EWG5	89 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	FAM25G	B3EWG6	89 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	RGS10	O43665	173 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	PDCD6	O75340	191 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	CA11	O75493	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	HBZ	P02008	142 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	GLA	P06280	429 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	SRM	P19623	302 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	HTR2C	P28335	458 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	CD83	Q01151	205 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	RNLS	Q5VYX0	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	OR10K2	Q6IF99	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	OR1L1	Q8NH94	360 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	SETD6	Q8TBK2	473 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	PHYHIP	Q92561	330 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	SGCD	Q92629	289 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	GHRL	Q9UBU3	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	TNC	P24821	2201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221		J3QRK9	145 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	SLC31A2	O15432	143 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	FGF16	O43320	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	TXNL1	O43396	289 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	ARL6IP5	O75915	188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	RGS11	O94810	467 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	PTTG1	O95997	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	AMY1A	P04745	511 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	UCHL1	P09936	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	CD1B	P29016	333 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	S100A5	P33763	92 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	MAP2K4	P45985	399 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	PPP5C	P53041	499 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	LOXL3	P58215	753 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	SLC35A2	P78381	396 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	SLC35B1	P78383	322 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	IRF3	Q14653	427 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	P2RY14	Q15391	338 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	TRAM1	Q15629	374 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221		Q3ZCU0	254 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	FCGR1B	Q92637	280 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	GALM	Q96C23	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-205	ENST00000497221	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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