RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 NBR2O15453 112 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 NAPSAO96009 420 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 IGF1P05019 195 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 SRMP19623 302 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 CHRNA7P36544 502 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 VEGFCP49767 419 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 OR10A3P58181 314 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 TAS2R43P59537 309 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 DGCR2P98153 550 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 FABP5Q01469 135 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 FHL3Q13643 280 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 SPHARQ15513 63 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 HES5Q5TA89 166 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 OVCH2Q7RTZ1 564 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 RNF152Q8N8N0 203 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 DCUN1D4Q92564 292 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM59Q9BXS4 323 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 OR51J1Q9H342 316 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 JPT1Q9UK76 154 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 ERGIC3Q9Y282 383 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC3-211ENST00000491581 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 H0YJW9 148 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 YPEL1O60688 119 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 LY86O95711 162 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 IGLV1-40P01703 118 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 IGKV1-16P04430 117 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 UCHL1P09936 223 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 APELAP0DMC3 54 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 CX3CL1P78423 397 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 HTD2P86397 168 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 MED21Q13503 144 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 LIN54Q6MZP7 749 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF880Q6PDB4 577 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 OR8U1Q8NH10 309 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 DPF1Q92782 380 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 GALMQ96C23 342 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 YPEL2Q96QA6 119 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 UQCC2Q9BRT2 126 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 AGMATQ9BSE5 352 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 MND1Q9BWT6 205 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 TM2D1Q9BX74 207 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 PECRQ9BY49 303 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 A0A075B6Q4 140 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 H7C2Y5 167 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 J3QRK9 145 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 NDUFA3O95167 84 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 HLA-DRB1P01911 266 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 CD1AP06126 327 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 ELANEP08246 267 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 CEACAM6P40199 344 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 RAB9AP51151 201 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 HLA-DRB3P79483 266 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 SSX1Q16384 188 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 Q3ZCU0 254 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 IGSF11Q5DX21 431 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 LCE2CQ5TA81 110 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 CDH26Q8IXH8 852 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 COMMD1Q8N668 190 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF383Q8NA42 475 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 NPBQ8NG41 125 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 ARPC1AQ92747 370 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 CCDC90BQ9GZT6 254 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 CST11Q9H112 138 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 PLGRKTQ9HBL7 147 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.88□□□□□ -1.31
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