RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489630.5

VWA3B-217, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 2

Gene VWA3B, Length 2,575 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-217ENST00000489630 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 GGNQ86UU5 652 aa8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 OR10V1Q8NGI7 309 aa8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 OR4F5Q8NH21 305 aa8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 ABHD3Q8WU67 409 aa8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 OR4F4Q96R69 305 aa8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 OR51I2Q9H344 312 aa8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 A0A096LPE4 126 aa8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 A0A1W2PPZ6 126 aa8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 B4E171 279 aa8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 SOX15O60248 233 aa8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 GYPAP02724 150 aa8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 FGF5P12034 268 aa8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 PDLIM4P50479 330 aa8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 SSR4P51571 173 aa8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 PCBD1P61457 104 aa8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 RPS16P62249 146 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 TNFRSF9Q07011 255 aa8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 TCEAL6Q6IPX3 200 aa8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 ACY3Q96HD9 319 aa8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 KCNS2Q9ULS6 477 aa8.69□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 BMP5P22003 454 aa8.68□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 CHRNA7P36544 502 aa8.68□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF585BQ52M93 769 aa8.68□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 OR2T10Q8NGZ9 312 aa8.68□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 OR10D3Q8NH80 312 aa8.68□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 PSMF1Q92530 271 aa8.68□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM18Q96B42 140 aa8.68□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.68□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 C5orf49A4QMS7 147 aa8.68□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 GJE1A6NN92 205 aa8.68□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 CLDN1O95832 211 aa8.68□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 UMODP07911 640 aa8.68□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 RFPL3SP0C7P2 107 aa8.68□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 PSMB3P49720 205 aa8.68□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 LRP11Q86VZ4 500 aa8.68□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 MKXQ8IYA7 352 aa8.68□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 SGCZQ96LD1 299 aa8.68□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.68□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 LILRA1O75019 489 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 SCGB1D1O95968 90 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 COX6A1P12074 109 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 EGR1P18146 543 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 PMP22Q01453 160 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 CEACAM21Q3KPI0 293 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 IMMP1LQ96LU5 166 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 SH2D2AQ9NP31 389 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 PRDM6Q9NQX0 595 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 OR6C3Q9NZP0 311 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 PAGE4O60829 102 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 WDR1O75083 606 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 NGFP01138 241 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 COLCA1Q6ZS62 124 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 SAXO1Q8IYX7 474 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 GBGT1Q8N5D6 347 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM9BQ9NQ34 198 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 R4GN57 208 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM250H0YL14 139 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 GGCTO75223 188 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 TRAPPC6AO75865 159 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 NPPCP23582 126 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 IQCJQ1A5X6 159 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 FAM78BQ5VT40 261 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 FAM216AQ8WUB2 273 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 PRRG4Q9BZD6 226 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 FSCN3Q9NQT6 498 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 FKBP11Q9NYL4 201 aa8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 NCKAP5O14513 1909 aa8.66□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa8.66□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 NUPR1O60356 82 aa8.66□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 IL3RAP26951 378 aa8.66□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 CNN1P51911 297 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 ARF1P84077 181 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 TFF3Q07654 80 aa8.66□□□□□ -1.02
VWA3B-217ENST00000489630 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.2 ms