RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-208	ENST00000487290	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	RDH8	Q9NYR8	311 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	C1RL	Q9NZP8	487 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	RNF212B	A8MTL3	300 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	CTDSP2	O14595	271 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	RAB29	O14966	203 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	HSPA12A	O43301	675 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	CHST1	O43916	411 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	TUSC2	O75896	110 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	TSPAN9	O75954	239 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	PTHLH	P12272	177 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	CEACAM6	P40199	344 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	RELB	Q01201	579 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	LYG1	Q8N1E2	194 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	ST8SIA5	O15466	376 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	OR2F2	O95006	317 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	CD1B	P29016	333 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	PRSS3	P35030	304 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	PLA1A	Q53H76	456 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	FBLN7	Q53RD9	439 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	DRAM1	Q8N682	238 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290		Q8N6K4	173 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	DPPA5	A6NC42	116 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	BET1	O15155	118 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	PROP1	O75360	226 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	RAB13	P51153	203 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	LSAMP	Q13449	338 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290		Q8N2B8	174 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	OR56B4	Q8NH76	319 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	NABP2	Q9BQ15	211 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	SOST	Q9BQB4	213 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	MMP27	Q9H306	513 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	C16orf95	Q9H693	158 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A1B0GUS0	222 aa		13.25	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	CCDC160	A6NGH7	325 aa		13.25	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM25A	B3EWG3	89 aa		13.25	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM25C	B3EWG5	89 aa		13.25	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM25G	B3EWG6	89 aa		13.25	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	CTDSPL	O15194	276 aa		13.25	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM106CP	P0CH98	169 aa		13.25	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	OR3A3	P47888	321 aa		13.25	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	FOXL1	Q12952	345 aa		13.25	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	MSMO1	Q15800	293 aa		13.25	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	LY6E	Q16553	131 aa		13.25	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		13.25	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	MCFD2	Q8NI22	146 aa		13.25	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	S1PR3	Q99500	378 aa		13.25	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	RGS5	O15539	181 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	RCVRN	P35243	200 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	REG1B	P48304	166 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	RAG2	P55895	527 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	ACTG1	P63261	375 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290		Q6ZSV7	163 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	DTX3	Q8N9I9	347 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	OR4F5	Q8NH21	305 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	ABHD1	Q96SE0	405 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	GINS4	Q9BRT9	223 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	IFT46	Q9NQC8	304 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	OR5H14	A6NHG9	310 aa		13.23	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290		M0QZK8	103 aa		13.23	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	FGF16	O43320	207 aa		13.23	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	TAS2R46	P59540	309 aa		13.23	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	CDK10	Q15131	360 aa		13.23	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		13.23	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM219	Q86XT9	240 aa		13.23	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		13.23	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		13.23	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	C5orf30	Q96GV9	206 aa		13.23	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		13.23	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		13.23	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		13.23	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		13.23	□□□□□ -0.29
HCLS1-208	ENST00000487290	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		13.23	□□□□□ -0.29

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