RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486941.1

SNRNP40-205, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 2

Gene SNRNP40, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-205	ENST00000486941	IGKV1D-12	P01611	117 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	MT-ND2	P03891	347 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	ISG15	P05161	165 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	CALCB	P10092	127 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF44	P15621	663 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMEM11	P17152	192 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	ATF1	P18846	271 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	CALB2	P22676	271 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	NFYB	P25208	207 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	PTGFR	P43088	359 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	POU3F4	P49335	361 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	RAB7A	P51149	207 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	DAP	P51397	102 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	SCN1B	Q07699	218 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMED1	Q13445	227 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	MADCAM1	Q13477	382 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	EBI3	Q14213	229 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	UTF1	Q5T230	341 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	C12orf73	Q69YU5	71 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941		Q6P435	159 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	SSX6	Q7RTT6	188 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	GID4	Q8IVV7	300 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR8H3	Q8N146	312 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	STPG2	Q8N412	459 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	DRAM1	Q8N682	238 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR8U1	Q8NH10	309 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR56B4	Q8NH76	319 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	TOMM40L	Q969M1	308 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	SPSB1	Q96BD6	273 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	FGGY	Q96C11	551 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	COQ2	Q96H96	371 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	OPALIN	Q96PE5	141 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	NEK6	Q9HC98	313 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	KRT84	Q9NSB2	600 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	PSG11	Q9UQ72	335 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941		H3BSH0	61 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941		M0R129	80 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	CCRL2	O00421	344 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	MPZL2	O60487	215 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	IGKV1D-33	P01593	117 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	IGKV1-33	P01594	117 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	OCM2	P0CE71	109 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	GZMH	P20718	246 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	EPHA2	P29317	976 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	HTR1F	P30939	366 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	ATP6V1E1	P36543	226 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	KIR3DL2	P43630	455 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	KCNJ3	P48549	501 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	INSL3	P51460	131 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	CCR9	P51686	369 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	RAB25	P57735	213 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	GNGT1	P63211	74 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	PAX5	Q02548	391 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF85	Q03923	595 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	BNIP1	Q12981	228 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	GPR50	Q13585	617 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	HES1	Q14469	280 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	CDK5R1	Q15078	307 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	CASC10	Q5T4H9	136 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	ELP2	Q6IA86	826 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	SPATA24	Q86W54	205 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNRNP40-205	ENST00000486941	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		3.05	□□□□□ -1.92

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