RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 HES4Q9HCC6 221 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 ABCA4P78363 2273 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1B0GU03 582 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 E7EQL1 145 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 TXNL1O43396 289 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 TDGF1P3P51864 188 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 IFITM3Q01628 133 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 RAB32Q13637 225 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF146Q15072 292 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 SYNGR2O43760 224 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 AGAP20933 346 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 PPOXP50336 477 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 Q8NA96 180 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 AGPAT2O15120 278 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 SIGLEC5O15389 551 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 IGKV1D-12P01611 117 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 BVESQ8NE79 360 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 OPN4Q9UHM6 478 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 CST7O76096 145 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 GOSR1O95249 250 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 MPC2O95563 127 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 MBP02144 154 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 PNKDQ8N490 385 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 GFI1Q99684 422 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 NMES1Q9C002 83 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 HRH4Q9H3N8 390 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 CGAP01215 116 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 LYNX1P0DP58 116 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 LCN2P80188 198 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 OR2C3Q8N628 320 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 A6NNC1 897 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM178BH3BS89 294 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 HPXP02790 462 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 G6PCP35575 357 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 LGALS7P47929 136 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 UQCRFS1P47985 274 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 PEA15Q15121 130 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM230Q96A57 120 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 GTF3C1Q12789 2109 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 CACNA1DQ01668 2161 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 C7orf66A4D0T2 115 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 OPN1MWP04001 364 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 OPRK1P41145 380 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 BPIFB3P59826 476 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 RHOVQ96L33 236 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 TRAV24A0A0B4J272 114 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 MLNRO43193 412 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 MPZP25189 248 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 WDFY1Q8IWB7 410 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 BAP18Q8IXM2 172 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 ACY3Q96HD9 319 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 PRR13Q9NZ81 148 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 RNF24Q9Y225 148 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF835Q9Y2P0 537 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 LILRA1O75019 489 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 TOX4O94842 621 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 TAS2R45P59539 299 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 DTD1Q8TEA8 209 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 LEAP2Q969E1 77 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 UHRF2Q96PU4 802 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 CEACAM18A8MTB9 384 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 FAM166AQ6J272 317 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-211ENST00000486161 MISP3Q96FF7 219 aa6.95□□□□□ -1.3
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