RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 XRCC2O43543 280 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 BPNT1O95861 308 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 PSMB6P28072 239 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 LUMP51884 338 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 DEFA5Q01523 94 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM74A3Q4VXF1 159 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 ARRDC1Q8N5I2 433 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 OR4S1Q8NGB4 309 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM234AQ9H0X4 552 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 WDR13Q9H1Z4 485 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 RAB18Q9NP72 206 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 ZFP57Q9NU63 452 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 R4GMQ9 66 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 M0R1W7 72 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 ANGPTL7O43827 346 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 CHST1O43916 411 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 FBXO24O75426 580 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 CHRM2P08172 466 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 SPARCP09486 303 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 CD28P10747 220 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 NDUFB7P17568 137 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM3AP98173 230 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 PJVKQ0ZLH3 352 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 PLA2G7Q13093 441 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 HMGN3Q15651 99 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 VAX1Q5SQQ9 334 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 HCP5Q6MZN7 132 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 OR10AC1Q8NH08 325 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 SPSB4Q96A44 273 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 R3HDM4Q96D70 268 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 SLAMF6Q96DU3 332 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 REEP6Q96HR9 211 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 AJUBAQ96IF1 538 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 GAFA1Q96PS6 74 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 AQP10Q96PS8 301 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 PDCD10Q9BUL8 212 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 COA4Q9NYJ1 87 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 MLXQ9UH92 298 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 DNAH9Q9NYC9 4486 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 RAB27BO00194 218 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 S100A8P05109 93 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 PET100P0DJ07 73 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 BDKRB2P30411 391 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 GNALP38405 381 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 GFOD2Q3B7J2 385 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 RNF212Q495C1 297 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF529Q6P280 563 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 CRIP3Q6Q6R5 217 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF788Q6ZQV5 615 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 COMMD1Q8N668 190 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 OR51A4Q8NGJ6 313 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 OR1S2Q8NGQ3 325 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM46BQ96A09 425 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 SGK3Q96BR1 496 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 SMIM8Q96KF7 97 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 VSIG4Q9Y279 399 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 OR2AT4A6NND4 320 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF878C9JN71 531 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 F8W036 122 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 CA11O75493 328 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 MPIG6BO95866 241 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 FCER2P06734 321 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 QRFPP83859 136 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM128Q5BJH2 165 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 PRSS54Q6PEW0 395 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 HOGA1Q86XE5 327 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 GLYATL2Q8WU03 294 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 MICU1Q9BPX6 476 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 TLNRD1Q9H1K6 362 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 MEGF9Q9H1U4 602 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 TUBA4BQ9H853 241 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 STAB2Q8WWQ8 2551 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM25EA8MYX2 175 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 PSMD9O00233 223 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 SIGLEC5O15389 551 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 SMIM6P0DI80 62 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 VSIG8P0DPA2 414 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 ECI1P42126 302 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 GABRA2P47869 451 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 BLOC1S1P78537 153 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 ARL6IP1Q15041 203 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM57BQ71RH2 274 aa9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms