RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478887.1

SFI1-222, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-222	ENST00000478887	OR2F2	O95006	317 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	PTHLH	P12272	177 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	ELK1	P19419	428 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	CD24	P25063	80 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	CD1B	P29016	333 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	CBX5	P45973	191 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	REG1B	P48304	166 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	EBI3	Q14213	229 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	CNIH2	Q6PI25	160 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	HOGA1	Q86XE5	327 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887		Q8N2B8	174 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	GHITM	Q9H3K2	345 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	RDH8	Q9NYR8	311 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SFI1-222	ENST00000478887	COL6A5	A8TX70	2615 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	RAB29	O14966	203 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	IGKV1D-33	P01593	117 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	IGKV1-33	P01594	117 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	HLA-DQB1	P01920	261 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	CTXN2	P0C2S0	81 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	FAM106CP	P0CH98	169 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	OR3A3	P47888	321 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	LSAMP	Q13449	338 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	MOB3B	Q86TA1	216 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887		Q8N6K4	173 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	BEST4	Q8NFU0	473 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	LINC01006	Q8NI28	216 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	SNAPC3	Q92966	411 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	NABP2	Q9BQ15	211 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF702P	Q9H963	129 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	BEX1	Q9HBH7	125 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	FAM25A	B3EWG3	89 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	FAM25C	B3EWG5	89 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	FAM25G	B3EWG6	89 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887		M0QZK8	103 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	PROP1	O75360	226 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	TPPP	O94811	219 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM11	P17152	192 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	NAT1	P18440	290 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	PRSS3	P35030	304 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	PROK1	P58294	105 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	LAX1	Q8IWV1	398 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	DTX3	Q8N9I9	347 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	GPX8	Q8TED1	209 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	S1PR3	Q99500	378 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	GINS4	Q9BRT9	223 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	GAB2	Q9UQC2	676 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	CCDC160	A6NGH7	325 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	SULT1C2	O00338	296 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	CTDSP2	O14595	271 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	RGS5	O15539	181 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	FGF16	O43320	207 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	TUSC2	O75896	110 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	MOS	P00540	346 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	AMY1A	P04745	511 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	AMY2A	P04746	511 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	OR8U9	P0C7N5	309 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	GPR12	P47775	334 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	ARPC4	P59998	168 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	HES1	Q14469	280 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	C11orf88	Q6PI97	169 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SFI1-222	ENST00000478887	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		7.56	□□□□□ -1.2

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