RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 C15orf65H3BRN8 121 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 TBPP20226 339 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 KCNJ3P48549 501 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 HMGN3Q15651 99 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 Q6ZS49 121 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 C14orf79Q96F83 325 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 TIMD4Q96H15 378 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 PCDHB10Q9UN67 800 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 UNC79Q9P2D8 2635 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 ZFHX3Q15911 3703 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 IGKV1-13P0DP09 117 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 KIR2DS4P43632 304 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 LUMP51884 338 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 RPL31P62899 125 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 KIR2DS1Q14954 304 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 LRRC10Q5BKY1 277 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM200BQ69YZ2 307 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 STOML3Q8TAV4 291 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 MARC2Q969Z3 335 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 KCNIP1Q9NZI2 227 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 KAAG1Q9UBP8 84 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 H7C1Q1 480 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 WNT2P09544 360 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 CEACAM6P40199 344 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 C17orf58Q2M2W7 97 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 ACTBL2Q562R1 376 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 DHRS11Q6UWP2 260 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 LHFPL1Q86WI0 220 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 FAM185AQ8N0U4 392 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF565Q8N9K5 539 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 PHB2Q99623 299 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 PDCD10Q9BUL8 212 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 FAM234AQ9H0X4 552 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 HSPA12AO43301 675 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.028e-7■□□□□ 11.3
ATG4B-217ENST00000475693 ARRDC1Q8N5I2 433 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 BPIFCQ8NFQ6 507 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 FGF16O43320 207 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 ATG12O94817 140 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 IL2RGP31785 369 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 OR10J5Q8NHC4 309 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 THAP6Q8TBB0 222 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 ZANQ9Y493 2812 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 A0A1W2PPE3 182 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 CGB3P0DN86 165 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 CGB7P0DN87 165 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 DEFA5Q01523 94 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 GALMQ96C23 342 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 C5orf66Q9H5L9 145 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 OR2S2Q9NQN1 319 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 CALYQ9NYX4 217 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 PRR13Q9NZ81 148 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 RNF150Q9ULK6 438 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 C9orf170A2RU37 121 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 PPYP01298 95 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 AKR1C4P17516 323 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 PAX5Q02548 391 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 FAM74A1Q5RGS3 127 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 MOB1BQ7L9L4 216 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 LINC00518Q8N0U6 118 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 LURAP1Q96LR2 239 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 ZNRD1Q9P1U0 126 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 WNK2Q9Y3S1 2297 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-217ENST00000475693 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-217ENST00000475693 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-217ENST00000475693 HEXAP06865 529 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-217ENST00000475693 PGAM2P15259 253 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-217ENST00000475693 NFYBP25208 207 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-217ENST00000475693 CTAG1AP78358 180 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-217ENST00000475693 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-217ENST00000475693 SVBPQ8N300 66 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-217ENST00000475693 SECTM1Q8WVN6 248 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-217ENST00000475693 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-217ENST00000475693 CLN8Q9UBY8 286 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-217ENST00000475693 PDZD2O15018 2839 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC168Q8NDH2 2452 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM218A2RU14 115 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-217ENST00000475693 DBX1A6NMT0 343 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-217ENST00000475693 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-217ENST00000475693 CYCSP99999 105 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-217ENST00000475693 PHLDA2Q53GA4 152 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-217ENST00000475693 C10orf91Q5T1B1 145 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-217ENST00000475693 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-217ENST00000475693 OR8B2Q96RD0 313 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms