RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 LINC01548A6NM66 108 aa14.85□□□□□ -0.03
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TRAPPC10-208ENST00000469521 CD33P20138 364 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 GADD45AP24522 165 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC6A1P30531 599 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 SOX6P35712 828 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 ACTBP60709 375 aa14.85□□□□□ -0.03
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TRAPPC10-208ENST00000469521 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 NR2C2APQ86WQ0 139 aa14.85□□□□□ -0.03
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TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF251Q9BRH9 671 aa14.85□□□□□ -0.03
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TRAPPC10-208ENST00000469521 ZFP57Q9NU63 452 aa14.85□□□□□ -0.03
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TRAPPC10-208ENST00000469521 OR1A1Q9P1Q5 309 aa14.85□□□□□ -0.03
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TRAPPC10-208ENST00000469521 MOGAT2Q3SYC2 334 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 PHF21AQ96BD5 680 aa14.84□□□□□ -0.03
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TRAPPC10-208ENST00000469521 AGMATQ9BSE5 352 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
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TRAPPC10-208ENST00000469521 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 CEACAM6P40199 344 aa14.83□□□□□ -0.04
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TRAPPC10-208ENST00000469521 KCTD21Q4G0X4 260 aa14.83□□□□□ -0.04
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TRAPPC10-208ENST00000469521 OXLD1Q5BKU9 147 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 TEX38Q6PEX7 206 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 TPRA1Q86W33 373 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
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TRAPPC10-208ENST00000469521 HLA-DRB1P01911 266 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 VDAC1P21796 283 aa14.82□□□□□ -0.04
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TRAPPC10-208ENST00000469521 CT45A5P0DMU8 189 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 CT45A7P0DMV0 189 aa14.81□□□□□ -0.04
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TRAPPC10-208ENST00000469521 C5orf64Q2M2E5 130 aa14.8□□□□□ -0.04
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TRAPPC10-208ENST00000469521 LINC00482Q8N8I6 264 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 OR5AN1Q8NGI8 311 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 NECAP2Q9NVZ3 263 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 RDH8Q9NYR8 311 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 WASHC3Q9Y3C0 194 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 DNAH3Q8TD57 4116 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 A0A075B6Q4 140 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 TGP01266 2768 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 IGHG4P01861 327 aa14.79□□□□□ -0.04
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