RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.13□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.13□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.13□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 EHFQ9NZC4 300 aa7.13□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.13□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 NAV3Q8IVL0 2385 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 BTBD17A6NE02 478 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 OOSP1A8MZH6 123 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 H3BUX3 64 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 ITGB1BP1O14713 200 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 TIMM23O14925 209 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 RAB29O14966 203 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 LANCL1O43813 399 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 AADACP22760 399 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 CD24P25063 80 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 FCGR2CP31995 323 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 ETV6P41212 452 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 GPR12P47775 334 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 ARHGDIBP52566 201 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 TAS2R46P59540 309 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 SLC9A3R2Q15599 337 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF79Q15937 498 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 LY6EQ16553 131 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 RPL39P5Q59GN2 51 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 MOB3BQ86TA1 216 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 Q8N402 240 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 ZDHHC22Q8N966 263 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 JMJD8Q96S16 334 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 S1PR3Q99500 378 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 AGMATQ9BSE5 352 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 TOLLIPQ9H0E2 274 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 OR2D2Q9H210 308 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 DPAGT1Q9H3H5 408 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 PIPOXQ9P0Z9 390 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF221Q9UK13 617 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 OR2W1Q9Y3N9 320 aa7.12□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 A0A0A6YYJ9 748 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 A0A1W2PPI3 338 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 VGLL3A8MV65 326 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 TUSC2O75896 110 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 CD3DP04234 171 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 CSF1P09603 554 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 IGKV1-13P0DP09 117 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 BRS3P32247 399 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 LUMP51884 338 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF137PP52743 207 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 TAS2R19P59542 299 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 FXYD4P59646 89 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 TSPAN5P62079 268 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 UBA52P62987 128 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 DYRK1AQ13627 763 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 OVCH2Q7RTZ1 564 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 DRAM1Q8N682 238 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM229BQ8NBD8 167 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 OR56B4Q8NH76 319 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 OR5R1Q8NH85 324 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 PIFOQ8TCI5 191 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 CAPSLQ8WWF8 208 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 CHIAQ9BZP6 476 aa7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 M0R1X1 148 aa7.1□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 TXNL1O43396 289 aa7.1□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 PPYP01298 95 aa7.1□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 IFNA6P05013 189 aa7.1□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 DYNLT3P51808 116 aa7.1□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 HERV-K104P61576 105 aa7.1□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 HES1Q14469 280 aa7.1□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 AANATQ16613 207 aa7.1□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 FBLN7Q53RD9 439 aa7.1□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 ACTBL2Q562R1 376 aa7.1□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 FAAP20Q6NZ36 180 aa7.1□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 STEAP1BQ6NZ63 245 aa7.1□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM17Q86X19 198 aa7.1□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM219Q86XT9 240 aa7.1□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 OR8H3Q8N146 312 aa7.1□□□□□ -1.27
CASQ1-202ENST00000467691 MFSD4AQ8N468 514 aa7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms