RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 PRR13Q9NZ81 148 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 U3KQE9 123 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 TSPOAP1O95153 1857 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 TRAV27A0A087WT01 109 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 TAX1BP3O14907 124 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 FAM157CP0CG43 387 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 VPREB1P12018 145 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 P2RY2P41231 377 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF519Q8TB69 540 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 TXNDC17Q9BRA2 123 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 WFDC1Q9HC57 220 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 NRKQ7Z2Y5 1582 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 GLI2P10070 1586 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 SH2D1BO14796 132 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 RS1O15537 224 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 NDUFB8O95169 186 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 ASIPP42127 132 aa4.83□□□□□ -1.64
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