RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 PITPNAQ00169 270 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 HLA-DRB5Q30154 266 aa9.31□□□□□ -0.92
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PRAME-210ENST00000442481 SIGIRRQ6IA17 410 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 ZNF497Q6ZNH5 498 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 C6orf201Q7Z4U5 140 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 OR9G1Q8NH87 305 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 SETD6Q8TBK2 473 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 PECRQ9BY49 303 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 SRRQ9GZT4 340 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
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PRAME-210ENST00000442481 SPINT2O43291 252 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 HLA-DQB1P01920 261 aa9.3□□□□□ -0.92
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PRAME-210ENST00000442481 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 GZMHP20718 246 aa9.3□□□□□ -0.92
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PRAME-210ENST00000442481 C6orf183Q5T699 404 aa9.3□□□□□ -0.92
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PRAME-210ENST00000442481 OR10X1Q8NGY0 326 aa9.3□□□□□ -0.92
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PRAME-210ENST00000442481 RPEQ96AT9 228 aa9.3□□□□□ -0.92
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PRAME-210ENST00000442481 SOSTQ9BQB4 213 aa9.3□□□□□ -0.92
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PRAME-210ENST00000442481 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa9.29□□□□□ -0.92
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PRAME-210ENST00000442481 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa9.29□□□□□ -0.92
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PRAME-210ENST00000442481 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
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PRAME-210ENST00000442481 CD40LGP29965 261 aa9.29□□□□□ -0.92
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PRAME-210ENST00000442481 TMEM95Q3KNT9 176 aa9.29□□□□□ -0.92
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PRAME-210ENST00000442481 FAAP24Q9BTP7 215 aa9.29□□□□□ -0.92
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PRAME-210ENST00000442481 KCNIP1Q9NZI2 227 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 HSF4Q9ULV5 492 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 KCNK7Q9Y2U2 307 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 A0A087X0M5 115 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 A0A1B0GX30 115 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 C3orf84H3BNL1 204 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 C15orf65H3BRN8 121 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 CTDSPLO15194 276 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 ORC5O43913 435 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 TPPPO94811 219 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 HBZP02008 142 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 CD3GP09693 182 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 PRSS3P35030 304 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 REG1BP48304 166 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 DGCR2P98153 550 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 ARL6IP1Q15041 203 aa9.28□□□□□ -0.92
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PRAME-210ENST00000442481 Q8N402 240 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 GDPD1Q8N9F7 314 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 OR10A7Q8NGE5 316 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 BORCS5Q969J3 196 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 TAF9BQ9HBM6 251 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 AK3Q9UIJ7 227 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 DSCAML1Q8TD84 2053 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 DNAH9Q9NYC9 4486 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 SERPINE3A8MV23 424 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 GABARAPH6UMI1 98 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 RAMP3O60896 148 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 CA11O75493 328 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 OR2F2O95006 317 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 GLAP06280 429 aa9.27□□□□□ -0.93
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