RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432387.5

COPS7B-211, Transcript of COP9 signalosome subunit 7B, humanhuman

TSL 4

Gene COPS7B, Length 584 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7B-211ENST00000432387 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.92□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 PHF21AQ96BD5 680 aa14.92□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 DIABLOQ9NR28 239 aa14.92□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 HSPA12AO43301 675 aa14.91□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 FGF16O43320 207 aa14.91□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 TMEM11P17152 192 aa14.91□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 HES1Q14469 280 aa14.91□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 IGSF11Q5DX21 431 aa14.91□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 GPR141Q7Z602 305 aa14.91□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.91□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 CMTM3Q96MX0 182 aa14.91□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 NABP2Q9BQ15 211 aa14.91□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.91□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 GAB2Q9UQC2 676 aa14.91□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 MOB4Q9Y3A3 225 aa14.91□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 TRAV18A0A075B6X5 111 aa14.9□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa14.9□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa14.9□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa14.9□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 TMEM235A6NFC5 223 aa14.9□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 ST8SIA5O15466 376 aa14.9□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 XRCC3O43542 346 aa14.9□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 PROP1O75360 226 aa14.9□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 HNF4GQ14541 408 aa14.9□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 S1PR3Q99500 378 aa14.9□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 PLSCR3Q9NRY6 295 aa14.9□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 RDH8Q9NYR8 311 aa14.9□□□□□ -0.02
COPS7B-211ENST00000432387 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa14.89□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 SSX5O60225 188 aa14.89□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 MOSP00540 346 aa14.89□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 OR3A3P47888 321 aa14.89□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 RORCP51449 518 aa14.89□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 LSAMPQ13449 338 aa14.89□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 ABCA11PQ4W5N1 156 aa14.89□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 C5orf56Q8N8D9 126 aa14.89□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 OR10J5Q8NHC4 309 aa14.89□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 ACOT12Q8WYK0 555 aa14.89□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 MAFIPQ8WZ33 124 aa14.89□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 ABHD14BQ96IU4 210 aa14.89□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa14.89□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 AUNIPQ9H7T9 357 aa14.89□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 CTXN2P0C2S0 81 aa14.88□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 RPL5P46777 297 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 GNG2P59768 71 aa14.88□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 UBE2NLQ5JXB2 153 aa14.88□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 OR8H1Q8NGG4 311 aa14.88□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa14.88□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 BET1O15155 118 aa14.87□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 CT45A6P0DMU7 189 aa14.87□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 CT45A5P0DMU8 189 aa14.87□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 CT45A7P0DMV0 189 aa14.87□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 CNIH2Q6PI25 160 aa14.87□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 SAMD12Q8N8I0 201 aa14.87□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 F2RL1P55085 397 aa14.86□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 RPL39P5Q59GN2 51 aa14.86□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 HOGA1Q86XE5 327 aa14.86□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 KLHDC1Q8N7A1 406 aa14.86□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 Q8N9W7 124 aa14.86□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 OR5AN1Q8NGI8 311 aa14.86□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 BCL7BQ9BQE9 202 aa14.86□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 RNF150Q9ULK6 438 aa14.86□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 APOA1P02647 267 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 VSIG10L2P0DP72 767 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 MC5RP33032 325 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 TMBIM6P55061 237 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 PRR31Q5SQ13 230 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 COMMD3Q9UBI1 195 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 ANXA10Q9UJ72 324 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 ZNF221Q9UK13 617 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 IGHG2P01859 326 aa14.84□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 OR8U9P0C7N5 309 aa14.84□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 CBX5P45973 191 aa14.84□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa14.84□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 OR8U1Q8NH10 309 aa14.84□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 RAB2BQ8WUD1 216 aa14.84□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 RITA1Q96K30 269 aa14.84□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 GINS4Q9BRT9 223 aa14.84□□□□□ -0.03
COPS7B-211ENST00000432387 OR5H14A6NHG9 310 aa14.83□□□□□ -0.04
COPS7B-211ENST00000432387 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
COPS7B-211ENST00000432387 H0YJW9 148 aa14.83□□□□□ -0.04
COPS7B-211ENST00000432387 HLA-DQB1P01920 261 aa14.83□□□□□ -0.04
COPS7B-211ENST00000432387 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
COPS7B-211ENST00000432387 PTHLHP12272 177 aa14.83□□□□□ -0.04
COPS7B-211ENST00000432387 GPR12P47775 334 aa14.83□□□□□ -0.04
COPS7B-211ENST00000432387 TAS2R20P59543 309 aa14.83□□□□□ -0.04
COPS7B-211ENST00000432387 MZT2AQ6P582 158 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms