RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGLV1-47P01700 117 aa13.82□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPR12P47775 334 aa13.82□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa13.82□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMED4Q7Z7H5 227 aa13.82□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa13.82□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 BVESQ8NE79 360 aa13.82□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR10X1Q8NGY0 326 aa13.82□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAHD2AQ96GK7 314 aa13.82□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBX15Q96SF7 602 aa13.82□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF150Q9ULK6 438 aa13.82□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1W2PPE3 182 aa13.81□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 HSD17B6O14756 317 aa13.81□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 DHFRP00374 187 aa13.81□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGLV2-14P01704 120 aa13.81□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 COX7A1P24310 79 aa13.81□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL3RAP26951 378 aa13.81□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 RND3P61587 244 aa13.81□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 HLA-DRB5Q30154 266 aa13.81□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM128Q5BJH2 165 aa13.81□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC25A42Q86VD7 318 aa13.81□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 LYG1Q8N1E2 194 aa13.81□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 PNKDQ8N490 385 aa13.81□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 DRAM1Q8N682 238 aa13.81□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABHD14BQ96IU4 210 aa13.81□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 C7orf69Q9H7B7 122 aa13.81□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC2A9Q9NRM0 540 aa13.81□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRAF2O60831 178 aa13.8□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 PI3P19957 117 aa13.8□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBE2E1P51965 193 aa13.8□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF137PP52743 207 aa13.8□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 DLX1P56177 255 aa13.8□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 PIGPP57054 158 aa13.8□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF626Q68DY1 528 aa13.8□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 HCP5Q6MZN7 132 aa13.8□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM71F2Q6NXP2 309 aa13.8□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 C11orf88Q6PI97 169 aa13.8□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ODF3L1Q8IXM7 274 aa13.8□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 S1PR3Q99500 378 aa13.8□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SDHAF2Q9NX18 166 aa13.8□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARID1AO14497 2285 aa13.8□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa13.8□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa13.79□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ODF3BA8MYP8 253 aa13.79□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa13.79□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARG1P05089 322 aa13.79□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 AKR1C4P17516 323 aa13.79□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHLDA2Q53GA4 152 aa13.79□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR4P4Q8NGL7 312 aa13.79□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 LHX4Q969G2 390 aa13.79□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF212BA8MTL3 300 aa13.78□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa13.78□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 MPPED1O15442 326 aa13.78□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL5P05113 134 aa13.78□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR4E1P0C645 316 aa13.78□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB25P57735 213 aa13.78□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 DHODHQ02127 395 aa13.78□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLRD1Q13241 179 aa13.78□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF66Q6ZN08 573 aa13.78□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q6ZNX1 250 aa13.78□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCTD9Q7L273 389 aa13.78□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SGPP2Q8IWX5 399 aa13.78□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM230Q96A57 120 aa13.78□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa13.77□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 B3GALNT1O75752 331 aa13.77□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 HTR1DP28221 377 aa13.77□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CEACAM3P40198 252 aa13.77□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 LGALS4P56470 323 aa13.77□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 MIDNQ504T8 468 aa13.77□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 C4orf46Q504U0 113 aa13.77□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 MINOS1Q5TGZ0 78 aa13.77□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa13.77□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa13.77□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF251Q9BRH9 671 aa13.77□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAA60Q9H7X0 242 aa13.77□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNRD1Q9P1U0 126 aa13.77□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa13.77□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa13.77□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa13.76□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 LEUTXA8MZ59 168 aa13.76□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 TXNL1O43396 289 aa13.76□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNFSF12O43508 249 aa13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.3 ms