RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381565.2

APOBEC3F-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3F, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3F, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3F-202ENST00000381565 LSAMPQ13449 338 aa9.15□□□□□ -0.94
APOBEC3F-202ENST00000381565 C10orf99Q6UWK7 81 aa9.15□□□□□ -0.94
APOBEC3F-202ENST00000381565 DTX3Q8N9I9 347 aa9.15□□□□□ -0.94
APOBEC3F-202ENST00000381565 OR2AK2Q8NG84 335 aa9.15□□□□□ -0.94
APOBEC3F-202ENST00000381565 OR5H6Q8NGV6 325 aa9.15□□□□□ -0.94
APOBEC3F-202ENST00000381565 MAFIPQ8WZ33 124 aa9.15□□□□□ -0.94
APOBEC3F-202ENST00000381565 SLC25A38Q96DW6 304 aa9.15□□□□□ -0.94
APOBEC3F-202ENST00000381565 ZNF251Q9BRH9 671 aa9.15□□□□□ -0.94
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APOBEC3F-202ENST00000381565 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP9.15□□□□□ -0.94
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APOBEC3F-202ENST00000381565 SLC23A1Q9UHI7 598 aa9.15□□□□□ -0.94
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APOBEC3F-202ENST00000381565 ETV7Q9Y603 341 aa9.12□□□□□ -0.95
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APOBEC3F-202ENST00000381565 CT45A6P0DMU7 189 aa9.11□□□□□ -0.95
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APOBEC3F-202ENST00000381565 CT45A7P0DMV0 189 aa9.11□□□□□ -0.95
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APOBEC3F-202ENST00000381565 CD83Q01151 205 aa9.11□□□□□ -0.95
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APOBEC3F-202ENST00000381565 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC3F-202ENST00000381565 C5orf30Q96GV9 206 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC3F-202ENST00000381565 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
APOBEC3F-202ENST00000381565 S1PR3Q99500 378 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC3F-202ENST00000381565 HSPB9Q9BQS6 159 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC3F-202ENST00000381565 FUNDC2Q9BWH2 189 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC3F-202ENST00000381565 ABCG5Q9H222 651 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC3F-202ENST00000381565 PIPOXQ9P0Z9 390 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC3F-202ENST00000381565 TNCP24821 2201 aa9.11□□□□□ -0.95
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