RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 Q6ZSR3 168 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 SLC25A26Q70HW3 274 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CATSPERDQ86XM0 798 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 HS3ST5Q8IZT8 346 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 FAM58AQ8N1B3 248 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 WFDC9Q8NEX5 89 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 OR10H4Q8NGA5 316 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 OR4X2Q8NGF9 303 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 OR4D6Q8NGJ1 314 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 OR10G8Q8NGN5 311 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF596Q8TC21 504 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 SLAMF9Q96A28 289 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 IL4I1Q96RQ9 567 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 TTTY10Q9BZA0 68 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CHST5Q9GZS9 411 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM133Q9H2Q1 129 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 RHOFQ9HBH0 211 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ADGRL4Q9HBW9 690 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 MTCH1Q9NZJ7 389 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 COPS3Q9UNS2 423 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 SNTNA6NMZ2 147 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 OOSP1A8MZH6 123 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 DFFBO76075 338 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 OR2F2O95006 317 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 PRKACAP17612 351 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 FASP25445 335 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 HTR1FP30939 366 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 POU3F4P49335 361 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 PAX9P55771 341 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF146Q15072 292 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 UBE2V2Q15819 145 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ATP6AP1Q15904 470 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 DEFB121Q5J5C9 76 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 VAX1Q5SQQ9 334 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 AADACL4Q5VUY2 407 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 KDM4DQ6B0I6 523 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 HEPN1Q6WQI6 88 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 UTS2BQ765I0 119 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 BATF2Q8N1L9 274 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 DYNAPQ8N1N2 210 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ABHD12Q8N2K0 398 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF565Q8N9K5 539 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CHST4Q8NCG5 386 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 OR51D1Q8NGF3 324 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 OR8J1Q8NGP2 316 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 SPSB1Q96BD6 273 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 TBX5Q99593 518 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 OSBPL10Q9BXB5 764 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 TAS2R3Q9NYW6 316 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 GNG8Q9UK08 70 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 POMPQ9Y244 141 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 SORL1Q92673 2214 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ODAMA1E959 279 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 F8VVB4 439 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 F8VWA3 439 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 H3BSH0 61 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 SIRPB1O00241 398 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 DEGS1O15121 323 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 MT-ND2P03891 347 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 HTR1AP08908 422 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF44P15621 663 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 IGLL1P15814 213 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ATF1P18846 271 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 BCL3P20749 454 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CDK2P24941 298 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CD34P28906 385 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 SLC6A1P30531 599 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 PTGFRP43088 359 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 NPBWR2P48146 333 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 HERV-K104P61576 105 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 SLC35B1P78383 322 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CYCSP99999 105 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 SCN1BQ07699 218 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 BNIP1Q12981 228 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 PDZK1IP1Q13113 114 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 RNF212Q495C1 297 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ABCA11PQ4W5N1 156 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 C9orf152Q5JTZ5 239 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 C12orf73Q69YU5 71 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CCDC121Q6ZUS5 278 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.4 ms