RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 C1QL4Q86Z23 238 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 OR1L1Q8NH94 360 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 R3HDM4Q96D70 268 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 CYYR1Q96J86 154 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 OR4F4Q96R69 305 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 SULT4A1Q9BR01 284 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 NICN1Q9BSH3 213 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 PECRQ9BY49 303 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 KCNK15Q9H427 330 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 RNF167Q9H6Y7 350 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 TAF9BQ9HBM6 251 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 JPT1Q9UK76 154 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0A6YYD4 124 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PRX2 142 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 G3V4G9 280 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 RAB27BO00194 218 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 SLC31A2O15432 143 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 SOCS1O15524 211 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 FGF16O43320 207 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 TPPPO94811 219 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 APOA1P02647 267 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 PF4P02776 101 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 CTXN2P0C2S0 81 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 TGFBR1P36897 503 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 CBX5P45973 191 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 GNG2P59768 71 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 VBP1P61758 197 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 NCS1P62166 190 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 CD83Q01151 205 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 ARFRP1Q13795 201 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 GNMTQ14749 295 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 CTF1Q16619 201 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 HACD4Q5VWC8 232 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF880Q6PDB4 577 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 ABCG5Q9H222 651 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 AK3Q9UIJ7 227 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 SMIM30A4D0T7 59 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 PSMB11A5LHX3 300 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 TRDCB7Z8K6 153 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 MFNGO00587 321 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 ITGB1BP1O14713 200 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 HSPA12AO43301 675 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 XRCC3O43542 346 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 PF4V1P10720 104 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 GNB3P16520 340 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 ZBTB25P24278 435 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 CD1BP29016 333 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF134P52741 427 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF137PP52743 207 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM50BP56557 158 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 HLA-DRB3P79483 266 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 EBI3Q14213 229 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 HMGN3Q15651 99 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 CDNFQ49AH0 187 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZS49 121 aa6.07□□□□□ -1.44
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