RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 OR10G8Q8NGN5 311 aa13.29□□□□□ -0.28
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PTPRU-201ENST00000345512 VAMP8Q9BV40 100 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRU-201ENST00000345512 CCKARP32238 428 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRU-201ENST00000345512 ICAM4Q14773 271 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRU-201ENST00000345512 LRTM2Q8N967 370 aa13.29□□□□□ -0.28
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PTPRU-201ENST00000345512 A0A0G2JMM0 328 aa13.29□□□□□ -0.28
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PTPRU-201ENST00000345512 A0A1W2PRS3 328 aa13.29□□□□□ -0.28
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PTPRU-201ENST00000345512 ST8SIA5O15466 376 aa13.28□□□□□ -0.28
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PTPRU-201ENST00000345512 SGMS2Q8NHU3 365 aa13.28□□□□□ -0.28
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PTPRU-201ENST00000345512 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
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PTPRU-201ENST00000345512 LRP11Q86VZ4 500 aa13.27□□□□□ -0.28
PTPRU-201ENST00000345512 LINC00469Q8N7U9 141 aa13.27□□□□□ -0.28
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PTPRU-201ENST00000345512 IMMP1LQ96LU5 166 aa13.27□□□□□ -0.28
PTPRU-201ENST00000345512 TTTY12Q9BZ98 90 aa13.27□□□□□ -0.28
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PTPRU-201ENST00000345512 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRU-201ENST00000345512 A0A087WWC5 75 aa13.27□□□□□ -0.29
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PTPRU-201ENST00000345512 C5orf24Q7Z6I8 188 aa13.27□□□□□ -0.29
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PTPRU-201ENST00000345512 SSUH2Q9Y2M2 353 aa13.27□□□□□ -0.29
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PTPRU-201ENST00000345512 PMS2CLQ68D20 193 aa13.26□□□□□ -0.29
PTPRU-201ENST00000345512 DHRS13Q6UX07 377 aa13.26□□□□□ -0.29
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PTPRU-201ENST00000345512 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
PTPRU-201ENST00000345512 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa13.26□□□□□ -0.29
PTPRU-201ENST00000345512 PROCRQ9UNN8 238 aa13.26□□□□□ -0.29
PTPRU-201ENST00000345512 M0R1B8 84 aa13.26□□□□□ -0.29
PTPRU-201ENST00000345512 PDE6DO43924 150 aa13.26□□□□□ -0.29
PTPRU-201ENST00000345512 HIST1H2BKO60814 126 aa13.26□□□□□ -0.29
PTPRU-201ENST00000345512 APOA2P02652 100 aa13.26□□□□□ -0.29
PTPRU-201ENST00000345512 HIST1H2BJP06899 126 aa13.26□□□□□ -0.29
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PTPRU-201ENST00000345512 HIST1H2BBP33778 126 aa13.26□□□□□ -0.29
PTPRU-201ENST00000345512 HIST1H2BDP58876 126 aa13.26□□□□□ -0.29
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