RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 PNKDQ8N490 385 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABHD14BQ96IU4 210 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDZD2O15018 2839 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 DLX1P56177 255 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIGPP57054 158 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 C11orf88Q6PI97 169 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 LDLRAD3Q86YD5 345 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 LYG1Q8N1E2 194 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZBTB34Q8NCN2 500 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNFRSF14Q92956 283 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 AGMATQ9BSE5 352 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIPOXQ9P0Z9 390 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB29O14966 203 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 TGFAP01135 160 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV4-31P0DP07 118 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 C4orf46Q504U0 113 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A42Q86VD7 318 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC00311Q8N616 119 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF596Q8TC21 504 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFI27L2Q9H2X8 130 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC2A9Q9NRM0 540 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRAF2O60831 178 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL3RAP26951 378 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 MSMO1Q15800 293 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q6ZNX1 250 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 DRAM1Q8N682 238 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 BVESQ8NE79 360 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 MMP9P14780 707 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 MECP2P51608 486 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM128Q5BJH2 165 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYB5R2Q6BCY4 276 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 SGPP2Q8IWX5 399 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAHD2AQ96GK7 314 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 AUP1Q9Y679 476 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 MED13LQ71F56 2210 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 TATDN3Q17R31 274 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 BEND2Q8NDZ0 799 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 S1PR3Q99500 378 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 C7orf69Q9H7B7 122 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 SDHAF2Q9NX18 166 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNFSF12O43508 249 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARG1P05089 322 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4E1P0C645 316 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 VAMP1P23763 118 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 RND3P61587 244 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLRD1Q13241 179 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR11H6Q8NGC7 330 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 CAPSLQ8WWF8 208 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBX15Q96SF7 602 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 GAB2Q9UQC2 676 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL5P05113 134 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 LHX4Q969G2 390 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNRD1Q9P1U0 126 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 VPS13CQ709C8 3753 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF212BA8MTL3 300 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 MPPED1O15442 326 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGLV2-14P01704 120 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 VSIG10L2P0DP72 767 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 HLA-DRB5Q30154 266 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBC1D26Q86UD7 250 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDZD9Q8IXQ8 264 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC168Q8NDH2 2452 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 J3QLI3 93 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 M0R1X1 148 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP1R1AQ13522 171 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPL39P5Q59GN2 51 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM230Q96A57 120 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 NAA60Q9H7X0 242 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGLV1-47P01700 117 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 LGALS4P56470 323 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 CATR1Q13166 79 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 CBX3Q13185 183 aa22.33■■□□□ 1.17
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