RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293373.10

NCKAP1L-201, Transcript of NCK associated protein 1 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NCKAP1L, Length 9,016 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1L-201ENST00000293373 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 IGSF11Q5DX21 431 aa6.71□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 MMP26Q9NRE1 261 aa6.71□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6.71□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.71□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 PINLYPA6NC86 204 aa6.71□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 PDGFAP04085 211 aa6.71□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 PNKDQ8N490 385 aa6.71□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 TPRX1Q8N7U7 411 aa6.71□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.71□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 ZNF716A6NP11 495 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 PITX3O75364 302 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 HPXP02790 462 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 LY6DQ14210 128 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 PRR27Q6MZM9 219 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 ABCA7Q8IZY2 2146 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 STARD4Q96DR4 205 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 LYPD3O95274 346 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 DBX1A6NMT0 343 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 ZNF154Q13106 437 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 BLNKQ8WV28 456 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 C17orf100A8MU93 164 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 ZNF737O75373 536 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 IGHG3P01860 377 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 THBDP07204 575 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 BTN1A1Q13410 526 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 TEX261Q6UWH6 196 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 CD74P04233 296 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 DYNLT3P51808 116 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 LOXL3P58215 753 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 UBE2V2Q15819 145 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 JMJD8Q96S16 334 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 NPAS1Q99742 590 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 SLC25A22Q9H936 323 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 RPEL1Q2QD12 228 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 ZNF429Q86V71 674 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 DOK5Q9P104 306 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 NPIPB7O75200 414 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 ADAP1O75689 374 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 CLLU1Q5K131 121 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 MYO7BQ6PIF6 2116 aa6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 SCGB1D1O95968 90 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 LINC00312Q9Y6C7 94 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 OR2C1O95371 312 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 NHLH1Q02575 133 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 ATP5G2Q06055 141 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 PLXNA3P51805 1871 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 MPDU1O75352 247 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 PRSS33Q8NF86 280 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 OR4X1Q8NH49 305 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 OR2A4O95047 310 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 CCL1P22362 96 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 SELENOTP62341 195 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 NUP37Q8NFH4 326 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 OR2A7Q96R45 310 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 MGAMO43451 1857 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 LMX1BO60663 402 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 TOX4O94842 621 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 CRYBA2P53672 197 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 ERVFC1-1P60608 527 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 ZNF79Q15937 498 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 Q6ZS92 163 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 MIA3Q5JRA6 1907 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 A1L4Q6 167 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 TMEM140Q9NV12 185 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 HYPMO75409 117 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 UCP3P55916 312 aa6.69□□□□□ -1.34
NCKAP1L-201ENST00000293373 GUK1Q16774 197 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms