RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289382.7

CNOT11-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT11, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11-201ENST00000289382 EDN3P14138 238 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 PPP1CBP62140 327 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 OR10V1Q8NGI7 309 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 FGFBP3Q8TAT2 258 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 CMTM2Q8TAZ6 248 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 YPEL2Q96QA6 119 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 TMEM106BQ9NUM4 274 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 PAM16Q9Y3D7 125 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 ASPMQ8IZT6 3477 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 COX6A1P12074 109 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 LIFP15018 202 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 ACSM6Q6P461 480 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 TEX43Q6ZNM6 134 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 WDYHV1Q96HA8 205 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 IL36RNQ9UBH0 155 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 VENTXO95231 258 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 SPANXN5Q5MJ07 72 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 LYSMD4Q5XG99 296 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 Q6ZWC4 215 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 A0A1W2PR80 420 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 CD300LBA8K4G0 201 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 VAMP5O95183 116 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 BCL3P20749 454 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 PSG4Q00888 419 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 IFI44Q8TCB0 444 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 HLA-CQ95604 372 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 IMMP1LQ96LU5 166 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 OR6C6A6NF89 314 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 S100GP29377 79 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 KIR2DS4P43632 304 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 SLC38A11Q08AI6 406 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 KIR2DS1Q14954 304 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 TMEM183BQ1AE95 376 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 TMEM144Q7Z5S9 345 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 NEK7Q8TDX7 302 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa15.92■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 GRIFINA4D1Z8 144 aa15.92■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 SIAH2O43255 324 aa15.92■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 IGKV1-39P01597 117 aa15.92■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 IGKV1D-39P04432 117 aa15.92■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 CD82P27701 267 aa15.92■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 TFPI2P48307 235 aa15.92■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 GNG10P50151 68 aa15.92■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 TCF21O43680 179 aa15.92■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 PAGE4O60829 102 aa15.92■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 CFIP05156 583 aa15.92■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 RFPL3SP0C7P2 107 aa15.92■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 OR8G2PQ6IF36 304 aa15.92■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 TCF23Q7RTU1 214 aa15.92■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 ASCL3Q9NQ33 180 aa15.92■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 TMEM38BQ9NVV0 291 aa15.92■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa15.91■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 IGHV3-9P01782 118 aa15.91■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 ADMP35318 185 aa15.91■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 DUSP23Q9BVJ7 150 aa15.91■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 ATP23Q9Y6H3 246 aa15.91■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 MLNRO43193 412 aa15.91■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 CDKN1AP38936 164 aa15.91■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 LINC01551Q86U37 167 aa15.91■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 VAMP8Q9BV40 100 aa15.91■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 WNT5BQ9H1J7 359 aa15.91■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 TIMM9Q9Y5J7 89 aa15.91■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 CTXN2P0C2S0 81 aa15.9■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 SPINK2P20155 84 aa15.9■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 NPPCP23582 126 aa15.9■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 PCSK4Q6UW60 755 aa15.9■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 OR10G9Q8NGN4 311 aa15.9■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 OR10G7Q8NGN6 311 aa15.9■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa15.9■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 SIT1Q9Y3P8 196 aa15.9■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 FREM1Q5H8C1 2179 aa15.9■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 IGKV1-5P01602 117 aa15.9■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 RANP62826 216 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 SLC23A3Q6PIS1 610 aa15.9■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa15.9■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 CLDN23Q96B33 292 aa15.9■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF407Q9C0G0 2248 aa15.9■□□□□ 0.14
CNOT11-201ENST00000289382 SOX8P57073 446 aa15.89■□□□□ 0.13
CNOT11-201ENST00000289382 TPPP2P59282 170 aa15.89■□□□□ 0.13
CNOT11-201ENST00000289382 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa15.89■□□□□ 0.13
CNOT11-201ENST00000289382 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa15.89■□□□□ 0.13
CNOT11-201ENST00000289382 C11orf42Q8N5U0 333 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms