RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 TNFRSF9Q07011 255 aa23.58■■□□□ 1.37
UBP1-201ENST00000283628 SSX7Q7RTT5 188 aa23.58■■□□□ 1.37
UBP1-201ENST00000283628 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
UBP1-201ENST00000283628 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
UBP1-201ENST00000283628 SPRR3Q9UBC9 169 aa23.58■■□□□ 1.37
UBP1-201ENST00000283628 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa23.58■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 CELA3BP08861 270 aa23.58■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 NDUFA6P56556 154 aa23.58■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 MSMO1Q15800 293 aa23.58■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 C1orf87Q8N0U7 546 aa23.58■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 UBALD1Q8TB05 177 aa23.58■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 HES4Q9HCC6 221 aa23.58■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 HSPB7Q9UBY9 170 aa23.58■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa23.57■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 CLDN34H7C241 214 aa23.57■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 YIF1AO95070 293 aa23.57■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 HAND1O96004 215 aa23.57■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 ZNF766Q5HY98 468 aa23.57■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa23.57■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 SDF2L1Q9HCN8 221 aa23.57■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 GALMQ96C23 342 aa23.56■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 RBKSQ9H477 322 aa23.56■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 NUBP1P53384 320 aa23.56■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 VASH2Q86V25 355 aa23.56■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 SLC25A40Q8TBP6 338 aa23.56■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 HIST1H2BKO60814 126 aa23.55■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 HIST1H2BJP06899 126 aa23.55■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 HIST1H2BOP23527 126 aa23.55■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 HIST1H2BBP33778 126 aa23.55■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 HIST1H2BDP58876 126 aa23.55■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 HIST1H2BCP62807 126 aa23.55■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 HIST2H2BEQ16778 126 aa23.55■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 ATP6V1FQ16864 119 aa23.55■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 HIST1H2BHQ93079 126 aa23.55■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 HIST1H2BNQ99877 126 aa23.55■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 HIST1H2BMQ99879 126 aa23.55■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 GGACTQ9BVM4 153 aa23.55■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa23.55■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 PCNX2A6NKB5 2137 aa23.55■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa23.55■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 CLDN1O95832 211 aa23.55■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 P0C879 139 aa23.55■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 S100A2P29034 98 aa23.55■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 SLC35E4Q6ICL7 350 aa23.55■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 FAM210BQ96KR6 192 aa23.55■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 CTDSP1Q9GZU7 261 aa23.55■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 DOCK7Q96N67 2140 aa23.54■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 CEBPZOSA8MTT3 80 aa23.54■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 ERVS71-1P61550 626 aa23.54■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa23.54■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 MED13Q9UHV7 2174 aa23.54■■□□□ 1.36
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UBP1-201ENST00000283628 IFITM10A6NMD0 228 aa23.53■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa23.53■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 SEC14L6B5MCN3 397 aa23.53■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 IGHV2-70P01814 119 aa23.53■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 GRPP07492 148 aa23.53■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 CATR1Q13166 79 aa23.53■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 OR2D2Q9H210 308 aa23.53■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 SLC39A9Q9NUM3 307 aa23.53■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 IGHV1-2P23083 117 aa23.53■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 ELLP55199 621 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 PSG7Q13046 419 aa23.53■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 ALKBH6Q3KRA9 238 aa23.53■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa23.53■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 AGMATQ9BSE5 352 aa23.53■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 TTC28Q96AY4 2481 aa23.52■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 C12orf77C9JDV5 145 aa23.52■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 PSPNO60542 156 aa23.52■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 ZNF737O75373 536 aa23.52■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 TRGC2P03986 189 aa23.52■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 IL2RGP31785 369 aa23.52■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 OR3A1P47881 315 aa23.52■■□□□ 1.36
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UBP1-201ENST00000283628 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 OR1L1Q8NH94 360 aa23.52■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 LHX4Q969G2 390 aa23.52■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
UBP1-201ENST00000283628 OPN1MWP04001 364 aa23.52■■□□□ 1.35
UBP1-201ENST00000283628 OPN1MW2P0DN77 364 aa23.52■■□□□ 1.35
UBP1-201ENST00000283628 OPN1MW3P0DN78 364 aa23.52■■□□□ 1.35
UBP1-201ENST00000283628 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.35
UBP1-201ENST00000283628 OR8G2PQ6IF36 304 aa23.52■■□□□ 1.35
UBP1-201ENST00000283628 TMEM178AQ8NBL3 297 aa23.52■■□□□ 1.35
UBP1-201ENST00000283628 KNTC1P50748 2209 aa23.51■■□□□ 1.35
UBP1-201ENST00000283628 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa23.51■■□□□ 1.35
UBP1-201ENST00000283628 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
UBP1-201ENST00000283628 LRRC30A6NM36 301 aa23.51■■□□□ 1.35
UBP1-201ENST00000283628 RAMP3O60896 148 aa23.51■■□□□ 1.35
UBP1-201ENST00000283628 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
UBP1-201ENST00000283628 DEFB124Q8NES8 71 aa23.51■■□□□ 1.35
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