RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 HBZP02008 142 aa9.15□□□□□ -0.94
GGPS1-201ENST00000282841 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
GGPS1-201ENST00000282841 TNFSF4P23510 183 aa9.15□□□□□ -0.94
GGPS1-201ENST00000282841 KIR2DS4P43632 304 aa9.15□□□□□ -0.94
GGPS1-201ENST00000282841 KIR2DS1Q14954 304 aa9.15□□□□□ -0.94
GGPS1-201ENST00000282841 C1orf174Q8IYL3 243 aa9.15□□□□□ -0.94
GGPS1-201ENST00000282841 ARL11Q969Q4 196 aa9.15□□□□□ -0.94
GGPS1-201ENST00000282841 HCFC1P51610 2035 aa9.15□□□□□ -0.94
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa9.15□□□□□ -0.94
GGPS1-201ENST00000282841 TEX46H3BTG2 121 aa9.15□□□□□ -0.94
GGPS1-201ENST00000282841 SIGLEC5O15389 551 aa9.15□□□□□ -0.94
GGPS1-201ENST00000282841 DIRAS3O95661 229 aa9.15□□□□□ -0.94
GGPS1-201ENST00000282841 IFNA7P01567 189 aa9.15□□□□□ -0.94
GGPS1-201ENST00000282841 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
GGPS1-201ENST00000282841 RAB4AP20338 218 aa9.15□□□□□ -0.94
GGPS1-201ENST00000282841 DHODHQ02127 395 aa9.15□□□□□ -0.94
GGPS1-201ENST00000282841 TESK1Q15569 626 aa9.15□□□□□ -0.94
GGPS1-201ENST00000282841 TBC1D26Q86UD7 250 aa9.15□□□□□ -0.94
GGPS1-201ENST00000282841 MUC15Q8N387 334 aa9.15□□□□□ -0.94
GGPS1-201ENST00000282841 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
GGPS1-201ENST00000282841 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa9.15□□□□□ -0.94
GGPS1-201ENST00000282841 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 SCGB1D2O95969 90 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 SPP1P10451 314 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 IL2RGP31785 369 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 TAS2R31P59538 309 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 RAP2BP61225 183 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 DEFA5Q01523 94 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 LYPD2Q6UXB3 125 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 BTNL3Q6UXE8 466 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 TUSC2O75896 110 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 LMO1P25800 156 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 FAM74A1Q5RGS3 127 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF880Q6PDB4 577 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 GLYATL2Q8WU03 294 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 ABHD14BQ96IU4 210 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 SCGB3A2Q96PL1 93 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 DNTTIP1Q9H147 329 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 OR2S2Q9NQN1 319 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 ZNRD1Q9P1U0 126 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 FCN3O75636 299 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 IRF2P14316 349 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 DLX1P56177 255 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 S100A10P60903 97 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 MZT1Q08AG7 82 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 SMCO1Q147U7 214 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 ETV3LQ6ZN32 361 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 OR4A4PQ8NGN8 299 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 NAA60Q9H7X0 242 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 OR2W1Q9Y3N9 320 aa9.14□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 TENM4Q6N022 2769 aa9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 MPPED1O15442 326 aa9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 RGS11O94810 467 aa9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 COL8A2P25067 703 aa9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 CLEC9AQ6UXN8 241 aa9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 KCNIP1Q9NZI2 227 aa9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 DOCK11Q5JSL3 2073 aa9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 MPC2O95563 127 aa9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 CFDP00746 253 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 IGLV2-14P01704 120 aa9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 SOD3P08294 240 aa9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 AVPI1Q5T686 147 aa9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 GGNBP1Q5YKI7 109 aa9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 GSG1LQ6UXU4 331 aa9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 COQ8AQ8NI60 647 aa9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 GALMQ96C23 342 aa9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 FAHD2AQ96GK7 314 aa9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 RSRP1Q9BUV0 290 aa9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 REG4Q9BYZ8 158 aa9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 FAM234AQ9H0X4 552 aa9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 LAMP3Q9UQV4 416 aa9.13□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa9.12□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 ODAMA1E959 279 aa9.12□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM8BA6NDV4 472 aa9.12□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.12□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 NDUFS7O75251 213 aa9.12□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 MMP23AO75900 390 aa9.12□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 MDH2P40926 338 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM187Q14656 261 aa9.12□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM268Q5VZI3 342 aa9.12□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 SLC25A24Q6NUK1 477 aa9.12□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 GAFA1Q96PS6 74 aa9.12□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 RHOFQ9HBH0 211 aa9.12□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
GGPS1-201ENST00000282841 PTPN13Q12923 2485 aa9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.8 ms