RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273317.4

LIMD1-201, Transcript of LIM domains containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMD1, Length 11,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-201ENST00000273317 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
LIMD1-201ENST00000273317 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.97□□□□□ -1.29
LIMD1-201ENST00000273317 STAG3L3P0CL85 134 aa6.97□□□□□ -1.29
LIMD1-201ENST00000273317 RTP5Q14D33 572 aa6.97□□□□□ -1.29
LIMD1-201ENST00000273317 NUP37Q8NFH4 326 aa6.97□□□□□ -1.29
LIMD1-201ENST00000273317 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
LIMD1-201ENST00000273317 DAOP14920 347 aa6.97□□□□□ -1.29
LIMD1-201ENST00000273317 LIFP15018 202 aa6.97□□□□□ -1.29
LIMD1-201ENST00000273317 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
LIMD1-201ENST00000273317 CTGFP29279 349 aa6.96□□□□□ -1.29
LIMD1-201ENST00000273317 GUSBP11Q6P575 273 aa6.96□□□□□ -1.29
LIMD1-201ENST00000273317 SGMS2Q8NHU3 365 aa6.96□□□□□ -1.29
LIMD1-201ENST00000273317 ASB5Q8WWX0 329 aa6.96□□□□□ -1.29
LIMD1-201ENST00000273317 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.96□□□□□ -1.29
LIMD1-201ENST00000273317 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.96□□□□□ -1.29
LIMD1-201ENST00000273317 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.96□□□□□ -1.29
LIMD1-201ENST00000273317 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF98A6NK75 572 aa6.96□□□□□ -1.29
LIMD1-201ENST00000273317 SOCS1O15524 211 aa6.96□□□□□ -1.29
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LIMD1-201ENST00000273317 FAM219BQ5XKK7 198 aa6.96□□□□□ -1.29
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LIMD1-201ENST00000273317 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.96□□□□□ -1.29
LIMD1-201ENST00000273317 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
LIMD1-201ENST00000273317 SIGLEC5O15389 551 aa6.96□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 SIGLEC14Q08ET2 396 aa6.96□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.96□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 KLK13Q9UKR3 277 aa6.96□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
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LIMD1-201ENST00000273317 ADIPOQQ15848 244 aa6.96□□□□□ -1.3
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LIMD1-201ENST00000273317 CDK2AP1O14519 115 aa6.96□□□□□ -1.3
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LIMD1-201ENST00000273317 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 SPINK2P20155 84 aa6.96□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 MFAP2P55001 183 aa6.96□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.96□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.96□□□□□ -1.3
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LIMD1-201ENST00000273317 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
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LIMD1-201ENST00000273317 PPM1DO15297 605 aa6.96□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 HTN1P15515 57 aa6.96□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 PLP1P60201 277 aa6.96□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 PDCD1Q15116 288 aa6.96□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.96□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 MED13Q9UHV7 2174 aa6.96□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.96□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 LMX1BO60663 402 aa6.96□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 FCARP24071 287 aa6.96□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa6.96□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
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LIMD1-201ENST00000273317 STPG3Q8N7X2 389 aa6.96□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.96□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 A0A1W2PS18 150 aa6.95□□□□□ -1.3
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LIMD1-201ENST00000273317 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.95□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 ERVFRD-1P60508 538 aa6.95□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
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LIMD1-201ENST00000273317 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.95□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.95□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 A0A1B0GTH9 108 aa6.95□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 PIGYQ3MUY2 71 aa6.95□□□□□ -1.3
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LIMD1-201ENST00000273317 RASL10BQ96S79 203 aa6.95□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.95□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 FCGR3AP08637 254 aa6.95□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 CT62P0C5K7 136 aa6.95□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.95□□□□□ -1.3
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LIMD1-201ENST00000273317 TNFSF10P50591 281 aa6.95□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 EMP1P54849 157 aa6.95□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.95□□□□□ -1.3
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LIMD1-201ENST00000273317 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.95□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 J3QR06 171 aa6.95□□□□□ -1.3
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LIMD1-201ENST00000273317 ZP4Q12836 540 aa6.95□□□□□ -1.3
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LIMD1-201ENST00000273317 MARVELD3Q96A59 401 aa6.95□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 THADAQ6YHU6 1953 aa6.95□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 WNT9BO14905 357 aa6.95□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 S1PR2O95136 353 aa6.95□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LIMD1-201ENST00000273317 NMUP48645 174 aa6.95□□□□□ -1.3
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