RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa18.05■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 ZNF611Q8N823 705 aa18.05■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 SFRP2Q96HF1 295 aa18.05■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 UQCR10Q9UDW1 63 aa18.05■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 TRAV39A0A0B4J263 110 aa18.05■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 SH2D1BO14796 132 aa18.05■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 HYPMO75409 117 aa18.05■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 SYNGR4O95473 234 aa18.05■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 PSMF1Q92530 271 aa18.05■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 PIGCQ92535 297 aa18.05■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 TIMM9Q9Y5J7 89 aa18.05■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa18.04■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa18.04■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa18.04■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 NXPH2O95156 264 aa18.04■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 NDUFB4O95168 129 aa18.04■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 IGKV1-5P01602 117 aa18.04■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 UBE2G2P60604 165 aa18.04■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 ATP6V1FQ16864 119 aa18.04■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 TMEM42Q69YG0 159 aa18.04■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 Q6ZS49 121 aa18.04■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 OR6C1Q96RD1 312 aa18.04■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 LRRC61Q9BV99 259 aa18.04■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa18.04■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 CRYGSP22914 178 aa18.04■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 ATP5G3P48201 142 aa18.04■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 SLC25A53Q5H9E4 307 aa18.04■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 C10orf128Q5T292 105 aa18.04■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 C1orf174Q8IYL3 243 aa18.04■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 APH1AQ96BI3 265 aa18.04■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 HS3ST6Q96QI5 342 aa18.04■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 LAMA1P25391 3075 aa18.04■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 IGLC2P0DOY2 106 aa18.03■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 IGLC3P0DOY3 106 aa18.03■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 FUT6P51993 359 aa18.03■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 RNF2Q99496 336 aa18.03■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 TMPRSS2O15393 492 aa18.03■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 DHHO43323 396 aa18.03■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 CBR3O75828 277 aa18.03■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 KRASP01116 189 aa18.03■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 STARD4Q96DR4 205 aa18.03■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa18.03■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa18.02■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 IL36RNQ9UBH0 155 aa18.02■□□□□ 0.48
ODC1-201ENST00000234111 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa18.02■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa18.02■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 S100GP29377 79 aa18.02■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 EXPH5Q8NEV8 1989 aa18.02■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 CLDN1O95832 211 aa18.01■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 TOMM40O96008 361 aa18.01■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 KITLGP21583 273 aa18.01■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 CADM4Q8NFZ8 388 aa18.01■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 OR5P3Q8WZ94 311 aa18.01■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 COX11Q9Y6N1 276 aa18.01■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 PATE4P0C8F1 98 aa18.01■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 THBS3P49746 956 aa18.01■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 PSG4Q00888 419 aa18.01■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 TFF3Q07654 80 aa18.01■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 PCSK4Q6UW60 755 aa18.01■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 PARM1Q6UWI2 310 aa18.01■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 OR1L3Q8NH93 324 aa18.01■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 TMEM54Q969K7 222 aa18.01■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 SGCZQ96LD1 299 aa18.01■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 GPR27Q9NS67 375 aa18.01■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 ZNF586Q9NXT0 402 aa18.01■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa18■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa18■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 BCL3P20749 454 aa18■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 KIR2DS4P43632 304 aa18■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 KIR2DS1Q14954 304 aa18■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa18■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 OR10G3Q8NGC4 313 aa18■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 METTL7AQ9H8H3 244 aa18■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 ATP23Q9Y6H3 246 aa18■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa18■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 F6UZH7 168 aa18■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 PTGDSP41222 190 aa18■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 BLKP51451 505 aa18■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 RPS16P62249 146 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 ZNF90Q03938 601 aa18■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 MCEMP1Q8IX19 187 aa18■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 OR2M3Q8NG83 312 aa18■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 ZNF407Q9C0G0 2248 aa18■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 FER1L5A0AVI2 2057 aa17.99■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 SYNGR3O43761 229 aa17.99■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 COX5AP20674 150 aa17.99■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 RHBDD2Q6NTF9 364 aa17.99■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 ZNF738Q8NE65 137 aa17.99■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 LRFN3Q9BTN0 628 aa17.99■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 GPX1P07203 203 aa17.99■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.8 ms