RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638939.1

PDE4D-229, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-229	ENST00000638939	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	KCTD7	Q96MP8	289 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ASCL2	Q99929	193 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	OR51J1	Q9H342	316 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	AP4S1	Q9Y587	144 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939		J3QLW9	94 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	AIP	O00170	330 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	OVOL1	O14753	267 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	SLC31A2	O15432	143 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	CD2	P06729	351 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	OR8U9	P0C7N5	309 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ZNF19	P17023	458 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	VHL	P40337	213 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	F2RL1	P55085	397 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	GNB1	P62873	340 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	MMD	Q15546	238 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	MLANA	Q16655	118 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	C6orf183	Q5T699	404 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	LYPD6	Q86Y78	171 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	GAPT	Q8N292	157 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	STX19	Q8N4C7	294 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	OR52N1	Q8NH53	320 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ARL11	Q969Q4	196 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ISOC1	Q96CN7	298 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	LGALS12	Q96DT0	336 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	GPER1	Q99527	375 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	CST11	Q9H112	138 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	METTL9	Q9H1A3	318 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	PALMD	Q9NP74	551 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939		A8MZ25	164 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939		E9PI62	339 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939		F5H697	171 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	NBR2	O15453	112 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	SPINT2	O43291	252 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	SAP30	O75446	220 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	CA11	O75493	328 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	SC5D	O75845	299 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	NDUFA3	O95167	84 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	CDRT1	O95170	752 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	MT-ND4	P03905	459 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	GTF2F2	P13984	249 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	GP9	P14770	177 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	SPN	P16150	400 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	GABRB1	P18505	474 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	SERPINA2	P20848	420 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	MYF6	P23409	242 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73

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