RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630804.2

SPTAN1-222, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SPTAN1, Length 7,812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-222ENST00000630804 TREM2Q9NZC2 230 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 ZNF117Q03924 483 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 PTOV1Q86YD1 416 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 A0A1W2PQM1 296 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 NPFFO15130 113 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 GUSBP11Q6P575 273 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 OR1L8Q8NGR8 309 aa7.24□□□□□ -1.25
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SPTAN1-222ENST00000630804 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
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SPTAN1-222ENST00000630804 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa7.24□□□□□ -1.25
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SPTAN1-222ENST00000630804 ZNF56Q15929 161 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 Q6ZS52 159 aa7.24□□□□□ -1.25
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SPTAN1-222ENST00000630804 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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SPTAN1-222ENST00000630804 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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SPTAN1-222ENST00000630804 R4GN57 208 aa7.23□□□□□ -1.25
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SPTAN1-222ENST00000630804 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa7.23□□□□□ -1.25
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SPTAN1-222ENST00000630804 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 FFAR1O14842 300 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 RAG2P55895 527 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 KRTCAP3Q53RY4 240 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 TSPO2Q5TGU0 170 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa7.23□□□□□ -1.25
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SPTAN1-222ENST00000630804 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 C21orf140B9A014 251 aa7.22□□□□□ -1.25
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SPTAN1-222ENST00000630804 S1PR2O95136 353 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 OR2K2Q8NGT1 345 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 C17orf51A8MQB3 221 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 HYPMO75409 117 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 ZNF774Q6NX45 483 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 MRGPRX3Q96LB0 322 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 STARD10Q9Y365 291 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 J3QR06 171 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-222ENST00000630804 LIPFP07098 398 aa7.22□□□□□ -1.25
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