RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 HSPB2Q16082 182 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 GCNT2Q8N0V5 402 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 LHX4Q969G2 390 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 STARD4Q96DR4 205 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 LRRC61Q9BV99 259 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 CSTL1Q9H114 145 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 S1PR5Q9H228 398 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 HIPK2Q9H2X6 1198 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 COX11Q9Y6N1 276 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 THADAQ6YHU6 1953 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF732B4DXR9 585 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 E9PLN8 166 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SPINK4O60575 86 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SMPD2O60906 423 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 TCN2P20062 427 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 MRGPRDQ8TDS7 321 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 C11orf40Q8WZ69 217 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 MED13Q9UHV7 2174 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 C1QTNF9P0C862 333 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 GNRHRP30968 328 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 THBS3P49746 956 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 COMPP49747 757 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 TPPP2P59282 170 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 PMP22Q01453 160 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SHBQ15464 509 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 KISS1Q15726 138 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SGCBQ16585 318 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 FNDC7Q5VTL7 733 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 CARD17Q5XLA6 110 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 DTX1Q86Y01 620 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF695Q8IW36 515 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SLC38A9Q8NBW4 561 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 OR5AU1Q8NGC0 362 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 OR8B12Q8NGG6 310 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF519Q8TB69 540 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 CST9LQ9H4G1 147 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 WIPI2Q9Y4P8 454 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 CIDEAO60543 219 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 IFNA5P01569 189 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 FAHP16930 419 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 CAPZBP47756 277 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 RPS18P62269 152 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 LCN12Q6JVE5 192 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 TSTD1Q8NFU3 115 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 OR8G5Q8NG78 346 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 OR1K1Q8NGR3 316 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM204Q9BSN7 226 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SAP30O75446 220 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 KBTBD11O94819 623 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF17P17021 662 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 DRD1P21728 446 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 AADACP22760 399 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 RPL15P61313 204 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 TLE3Q04726 772 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 MSMO1Q15800 293 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA0895LQ68EN5 471 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SVIPQ8NHG7 77 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 FAM131CQ96AQ9 280 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 IL19Q9UHD0 177 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 CACNA1BQ00975 2339 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 EML6Q6ZMW3 1958 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 FRG2CA6NGY1 282 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 RAB29O14966 203 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 RER1O15258 196 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 TIAF1O95411 115 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 CLPSP04118 112 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 IFI6P09912 130 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 UBE2G2P60604 165 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ARL16Q0P5N6 197 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.03□□□□□ -1.28
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