RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597793.5

PTOV1-209, Transcript of prostate tumor overexpressed 1, human

TSL 1 (best)

Gene PTOV1, Length 1,716 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTOV1-209	ENST00000597793	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		16.07	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	16.07	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		16.06	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	16.06	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	LEUTX	A8MZ59	168 aa		16.06	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	16.06	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	CCS	O14618	274 aa		16.06	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	GPR37	O15354	613 aa		16.06	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	IGHV2-5	P01817	119 aa		16.06	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	CD177	Q8N6Q3	437 aa		16.06	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	CCL13	Q99616	98 aa		16.06	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		16.06	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	NAA60	Q9H7X0	242 aa		16.06	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		16.06	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	WNT2	P09544	360 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	FXYD4	P59646	89 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	RND3	P61587	244 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	PAX5	Q02548	391 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	GAFA1	Q96PS6	74 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	NDUFB3	O43676	98 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	B3GALNT1	O75752	331 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	COL10A1	Q03692	680 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	LRTM2	Q8N967	370 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	SNX22	Q96L94	193 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	CITED4	Q96RK1	184 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	MFF	Q9GZY8	342 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	ARL6	Q9H0F7	186 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	KIF25	Q9UIL4	384 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793		A0A096LNT2	108 aa		16.04	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793		A0A0D9SG52	128 aa		16.04	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		16.04	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	C5orf51	A6NDU8	294 aa		16.04	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	RNF223	E7ERA6	249 aa		16.04	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	BET1	O15155	118 aa		16.04	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	16.04	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	LMO4	P61968	165 aa		16.04	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		16.04	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	CLN8	Q9UBY8	286 aa		16.04	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		16.04	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	FAM25E	A8MYX2	175 aa		16.03	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793		K7N7A8	449 aa		16.03	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	16.03	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	GNB2	P62879	340 aa		16.03	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	HMGN3	Q15651	99 aa		16.03	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	ZNF546	Q86UE3	836 aa		16.03	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	16.03	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		16.03	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		16.03	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	SEC22A	Q96IW7	307 aa		16.03	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		16.03	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	16.03	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		16.03	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	PSPN	O60542	156 aa		16.02	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	ZNF737	O75373	536 aa		16.02	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	ZNF345	Q14585	488 aa		16.02	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		16.02	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		16.02	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		16.02	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		16.02	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	KIRREL1	Q96J84	757 aa		16.02	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.16
PTOV1-209	ENST00000597793	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		16.02	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	DVL1	O14640	695 aa		16.02	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	FOXH1	O75593	365 aa		16.02	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	OR2F2	O95006	317 aa		16.02	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	PSMB6	P28072	239 aa		16.02	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	GNRHR	P30968	328 aa		16.02	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	SRPX	P78539	464 aa		16.02	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	OR2F1	Q13607	317 aa		16.02	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	TMEM187	Q14656	261 aa		16.02	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		16.02	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	SLC51B	Q86UW2	128 aa		16.02	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	C2orf50	Q96LR7	162 aa		16.02	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		16.02	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	NOTCH2	Q04721	2471 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793		A8MXK9	166 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	GPR31	O00270	319 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	ADAP1	O75689	374 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	THAP6	Q8TBB0	222 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	C1orf159	Q96HA4	380 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PTOV1-209	ENST00000597793	MGST3	O14880	152 aa		16	■□□□□ 0.15

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