RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592790.1

VMP1-216, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

Gene VMP1, Length 4,325 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-216	ENST00000592790	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	IGSF23	A1L1A6	192 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790		H3BP45	60 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	HSPB6	O14558	160 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	TNFSF12	O43508	249 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	CLPS	P04118	112 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	ADH4	P08319	380 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM11	P17152	192 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	IL11	P20809	199 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	ID3	Q02535	119 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	PIGY	Q3MUY2	71 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	FADS6	Q8N9I5	356 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	DTD1	Q8TEA8	209 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790		Q8WTZ3	238 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	RARRES2	Q99969	163 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	DECR2	Q9NUI1	292 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	NAGK	Q9UJ70	344 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	AKAP9	Q99996	3911 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790		A0A0A6YYD4	124 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	HIST1H2BK	O60814	126 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	NXPH3	O95157	252 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	IGHV2-70	P01814	119 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	HIST1H2BO	P23527	126 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	HIST1H2BB	P33778	126 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	MPL	P40238	635 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	RND2	P52198	227 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	HIST1H2BD	P58876	126 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	HIST1H2BC	P62807	126 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	SRY	Q05066	204 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	FAM78B	Q5VT40	261 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM45B	Q96B21	275 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	S1PR3	Q99500	378 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	FUT9	Q9Y231	359 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	RAB29	O14966	203 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	C1QL1	O75973	258 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	NGF	P01138	241 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	OR5G3	P0C626	314 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	BCL3	P20749	454 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	GABRA2	P47869	451 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	ERVFC1-1	P60608	527 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	ERVS71-1	P61550	626 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	PAX5	Q02548	391 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	IL15RA	Q13261	267 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	COTL1	Q14019	142 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	ASCL4	Q6XD76	172 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	OR10D3	Q8NH80	312 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	FBXO17	Q96EF6	278 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	SLC35E1	Q96K37	410 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	TP53RK	Q96S44	253 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	SLC25A22	Q9H936	323 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	BET1L	Q9NYM9	111 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	CFAP54	Q96N23	3096 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	CREBBP	Q92793	2442 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	SIRPB1	O00241	398 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	SYNGR3	O43761	229 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	FOSL2	P15408	326 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	KLK2	P20151	261 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	BRS3	P32247	399 aa		3.04	□□□□□ -1.92

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