RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 OR8B3Q8NGG8 313 aa18.8■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 OR8U1Q8NH10 309 aa18.8■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 IL22RA2Q969J5 263 aa18.8■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 OR8B2Q96RD0 313 aa18.8■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 SPIN2AQ99865 258 aa18.8■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa18.8■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 CCL28Q9NRJ3 127 aa18.8■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 DBX1A6NMT0 343 aa18.79■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 H0Y980 276 aa18.79■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 C15orf65H3BRN8 121 aa18.79■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 F12P00748 615 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 SERPINE2P07093 398 aa18.79■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 RPS2P15880 293 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 SSTR5P35346 364 aa18.79■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 EFNA4P52798 201 aa18.79■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 ESCO2Q56NI9 601 aa18.79■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa18.79■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF695Q8IW36 515 aa18.79■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 NMES1Q9C002 83 aa18.79■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa18.79■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 TMED3Q9Y3Q3 217 aa18.79■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa18.78■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa18.78■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1W2PPE2 198 aa18.78■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1W2PR64 198 aa18.78■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1W2PRV1 198 aa18.78■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 PPIHO43447 177 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV2-70P01814 119 aa18.78■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 OR5AC1P0C628 307 aa18.78■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 Q3ZCU0 254 aa18.78■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 LDLRAD3Q86YD5 345 aa18.78■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 OR52L2PQ8NGH6 319 aa18.78■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00574Q9H8X3 128 aa18.78■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 DCAF16Q9NXF7 216 aa18.78■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 DVL1O14640 695 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 RP2O75695 350 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 IGKV1-13P0DP09 117 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 COL8A2P25067 703 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 F2RP25116 425 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM187Q14656 261 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD55Q3KP44 614 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 RFESDQ8TAC1 157 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 C2orf50Q96LR7 162 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF714Q96N38 554 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM222Q9H0R3 208 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 CACNA1DQ01668 2161 aa18.76■□□□□ 0.59
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CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
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CAPNS1-212ENST00000591041 SMCO1Q147U7 214 aa18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF66Q6ZN08 573 aa18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 THAP6Q8TBB0 222 aa18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 OR2D2Q9H210 308 aa18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 GFOD1Q9NXC2 390 aa18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 SIX6O95475 246 aa18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 CGB3P0DN86 165 aa18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 CGB7P0DN87 165 aa18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 H2BFSP57053 126 aa18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 MORN2Q502X0 79 aa18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 UBALD1Q8TB05 177 aa18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 CD300LFQ8TDQ1 290 aa18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 PIPOXQ9P0Z9 390 aa18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 RLN2P04090 185 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 HOXB5P09067 269 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 SELLP14151 372 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 UCP1P25874 307 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM56Q96MV1 263 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 GAB2Q9UQC2 676 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 HMSDA8MTL9 139 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 LTC4SQ16873 150 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 HEPN1Q6WQI6 88 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 DRAM1Q8N682 238 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 DCTN5Q9BTE1 182 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 PSG11Q9UQ72 335 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 CDS2O95674 445 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 PSMB6P28072 239 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 KIR2DS2P43631 304 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 C17orf58Q2M2W7 97 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM268Q5VZI3 342 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 GLYATL2Q8WU03 294 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 ADTRPQ96IZ2 230 aa18.72■□□□□ 0.59
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