RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 WFDC11Q8NEX6 87 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 OR1S2Q8NGQ3 325 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 RDH5Q92781 318 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 ACANP16112 2415 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF205O95201 554 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM33P57088 247 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 C11orf1Q9H5F2 150 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 HS3ST1O14792 307 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 NXPH2O95156 264 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2H2O95918 312 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 FOSL1P15407 271 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF718Q3SXZ3 478 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM209AQ5JX71 171 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 C17orf50Q8WW18 174 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 THBDP07204 575 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 SEC11BP0C7V7 166 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 HMGN3Q15651 99 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 MSMO1Q15800 293 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 TAAR3PQ9P1P4 343 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5H1A6NKK0 313 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 SCGB1D2O95969 90 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 IGKV1-13P0DP09 117 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 F2RP25116 425 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 NMSQ5H8A3 153 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 C20orf204Q6ZNR8 217 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXRED2Q8IWF2 684 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 OR10V1Q8NGI7 309 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 TOLLIPQ9H0E2 274 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2S2Q9NQN1 319 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 PARP11Q9NR21 331 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 LGALS8O00214 317 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 CECR9P0C854 216 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 CD200P41217 278 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB5CP51148 216 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 PJVKQ0ZLH3 352 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 DMBX1Q8NFW5 382 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 GINS3Q9BRX5 216 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 CCL28Q9NRJ3 127 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 IFNL4K9M1U5 179 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 HSPB6O14558 160 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 PAX5Q02548 391 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC35E4Q6ICL7 350 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 OR52M1Q8NGK5 317 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A31Q9H0C2 315 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 CDIPTO14735 213 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 GCH1P30793 250 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 MPV17P39210 176 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 ERVS71-1P61550 626 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 SPAG16Q8N0X2 631 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 COMMD1Q8N668 190 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBTB34Q8NCN2 500 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 BPIFCQ8NFQ6 507 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PR80 420 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 HAND1O96004 215 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 ID3Q02535 119 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 MST1LQ2TV78 715 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM216AQ8WUB2 273 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A15Q9Y619 301 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1B0GU03 582 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM218A2RU14 115 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 ALKBH6Q3KRA9 238 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 C10orf91Q5T1B1 145 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 LYPD6BQ8NI32 183 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 HSD17B6O14756 317 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 MLNRO43193 412 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 HEXAP06865 529 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 BAXQ07812 192 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 TIMM23BQ5SRD1 257 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM90A1Q86YD7 464 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 C11orf53Q8IXP5 236 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2C3Q8N628 320 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 OR10Z1Q8NGY1 313 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNIP1Q9NZI2 227 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF212BA8MTL3 300 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 SIRPB1O00241 398 aa21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms