RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580357.1

IFT20-210, Transcript of intraflagellar transport 20, human

TSL 3

Gene IFT20, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT20-210	ENST00000580357	DIRAS3	O95661	229 aa		13.14	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	CD24	P25063	80 aa		13.14	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	SERPINB10	P48595	397 aa		13.14	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	HLA-DRB3	P79483	266 aa		13.14	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	ARFRP1	Q13795	201 aa		13.14	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	EBI3	Q14213	229 aa		13.14	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	HES1	Q14469	280 aa		13.14	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	KIR2DS1	Q14954	304 aa		13.14	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		13.14	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	CDNF	Q49AH0	187 aa		13.14	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	IDNK	Q5T6J7	187 aa		13.14	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		13.14	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	LYG1	Q8N1E2	194 aa		13.14	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		13.14	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		13.14	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	OR56B4	Q8NH76	319 aa		13.14	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		13.14	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	CFHR4	Q92496	578 aa		13.14	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		13.14	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357		A0A0A6YYH2	397 aa		13.13	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357		A6NJ64	397 aa		13.13	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	MFNG	O00587	321 aa		13.13	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	RAB29	O14966	203 aa		13.13	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		13.13	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	GNB3	P16520	340 aa		13.13	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	TMEM11	P17152	192 aa		13.13	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	CEACAM6	P40199	344 aa		13.13	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		13.13	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		13.13	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		13.13	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	ZNF702P	Q9H963	129 aa		13.13	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	DIABLO	Q9NR28	239 aa		13.13	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	SPATA2	Q9UM82	520 aa		13.13	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	SLC31A2	O15432	143 aa		13.12	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	FGF16	O43320	207 aa		13.12	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	WIPF1	O43516	503 aa		13.12	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	PEX14	O75381	377 aa		13.12	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	SCT	P09683	121 aa		13.12	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	DTYMK	P23919	212 aa		13.12	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	BLCAP	P62952	87 aa		13.12	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		13.12	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		13.12	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357		Q6ZS49	121 aa		13.12	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		13.12	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	CYYR1	Q96J86	154 aa		13.12	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	S1PR3	Q99500	378 aa		13.12	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		13.12	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		13.12	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		13.12	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		13.12	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		13.12	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357		A0A075B6Q4	140 aa		13.11	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	MOS	P00540	346 aa		13.11	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	IGKV1D-33	P01593	117 aa		13.11	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	IGKV1-33	P01594	117 aa		13.11	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	FCGR3A	P08637	254 aa		13.11	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	REG1B	P48304	166 aa		13.11	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	GNMT	Q14749	295 aa		13.11	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	HERPUD1	Q15011	391 aa		13.11	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	HACD4	Q5VWC8	232 aa		13.11	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357		Q6ZPA2	131 aa		13.11	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		13.11	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		13.11	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		13.11	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	FABP7	O15540	132 aa		13.1	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		13.1	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		13.1	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		13.1	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		13.1	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		13.1	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		13.1	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357		M0QZ24	198 aa		13.09	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	CTXN2	P0C2S0	81 aa		13.09	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		13.09	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	HNF4G	Q14541	408 aa		13.09	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		13.09	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	PRR31	Q5SQ13	230 aa		13.09	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		13.09	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		13.09	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		13.09	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	ABCG5	Q9H222	651 aa		13.09	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	ZNF221	Q9UK13	617 aa		13.09	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	ANK2	Q01484	3957 aa		13.08	□□□□□ -0.31
IFT20-210	ENST00000580357	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		13.08	□□□□□ -0.32
IFT20-210	ENST00000580357	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
IFT20-210	ENST00000580357	GSTT2	P0CG29	244 aa		13.08	□□□□□ -0.32

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