RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 HERPUD1Q15011 391 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5R1Q8NH85 324 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPEQ96AT9 228 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 CABLES2Q9BTV7 478 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC31A2O15432 143 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 DPPA5A6NC42 116 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTDSP2O14595 271 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 HLA-DQB1P01920 261 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2AK2Q8NG84 335 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 MIXL1Q9H2W2 232 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNFRSF19Q9NS68 423 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR1A1Q9P1Q5 309 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAM30Q9UKF2 790 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL3RAP26951 378 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 CBX5P45973 191 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGDIBP52566 201 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLA1AQ53H76 456 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 TOMM40LQ969M1 308 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 H3BUX3 64 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEACAM6P40199 344 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 DYNLT3P51808 116 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGSF11Q5DX21 431 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 LAX1Q8IWV1 398 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHIAQ9BZP6 476 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCB10Q9NRK6 738 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 EXTL2Q9UBQ6 330 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF137PP52743 207 aa26.7■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 MCFD2Q8NI22 146 aa26.7■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM216AQ8WUB2 273 aa26.7■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 EDARADDQ8WWZ3 215 aa26.7■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 VPREB3Q9UKI3 123 aa26.7■■□□□ 1.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa26.7■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITGB1BP1O14713 200 aa26.7■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 BET1O15155 118 aa26.7■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRSS3P35030 304 aa26.7■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB7AP51149 207 aa26.7■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 C16orf87Q6PH81 154 aa26.7■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10J5Q8NHC4 309 aa26.7■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANXA10Q9UJ72 324 aa26.7■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSD17B6O14756 317 aa26.69■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 HOGA1Q86XE5 327 aa26.69■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 GVQW1Q8N7I0 195 aa26.69■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 BEST4Q8NFU0 473 aa26.69■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIFOQ8TCI5 191 aa26.69■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa26.69■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 TOLLIPQ9H0E2 274 aa26.69■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 TPPPO94811 219 aa26.68■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa26.68■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 LYG1Q8N1E2 194 aa26.68■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTXN2P0C2S0 81 aa26.67■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 BRS3P32247 399 aa26.67■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB13P51153 203 aa26.67■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNIH2Q6PI25 160 aa26.67■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNX29P2Q8IUI4 249 aa26.67■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 RDH8Q9NYR8 311 aa26.67■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR8H3Q8N146 312 aa26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM158Q8WZ71 300 aa26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 GINS4Q9BRT9 223 aa26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFI27L2Q9H2X8 130 aa26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFT46Q9NQC8 304 aa26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 LPLP06858 475 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 AGMATQ9BSE5 352 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 GHITMQ9H3K2 345 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCPEP1Q9HB40 452 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 A3GALT2U3KPV4 340 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PPI3 338 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 MEIS3P1A6NDR6 274 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 ST8SIA5O15466 376 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXB2Q5VYV0 432 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 ODF3L1Q8IXM7 274 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPX8Q8TED1 209 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 C15orf40Q8WUR7 153 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIPOXQ9P0Z9 390 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 TXNL1O43396 289 aa26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL15P61313 204 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 DIRAS2Q96HU8 199 aa26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 MMP27Q9H306 513 aa26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANAPC10Q9UM13 185 aa26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCF19Q9Y242 345 aa26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 REG1BP48304 166 aa26.63■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARPC4P59998 168 aa26.63■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 LY6EQ16553 131 aa26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms