RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570139.1

CNOT1-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 1, human

TSL 2

Gene CNOT1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT1-222	ENST00000570139	CBX5	P45973	191 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	OR3A4P	P47883	348 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	FHIT	P49789	147 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	PSG7	Q13046	419 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	OR8G1	Q15617	311 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	TRIM16L	Q309B1	348 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	ELP2	Q6IA86	826 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	OR2T2	Q6IF00	324 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	CMBL	Q96DG6	245 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM100	Q9NV29	134 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	COPZ2	Q9P299	210 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	ING4	Q9UNL4	249 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	SERPINE3	A8MV23	424 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	PPIAL4D	F5H284	164 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	SH2D1B	O14796	132 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	RBBP9	O75884	186 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	SLPI	P03973	132 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	GLA	P06280	429 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	FCER2	P06734	321 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	MELTF	P08582	738 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	TBP	P20226	339 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	CALCR	P30988	508 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	HAAO	P46952	286 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	GPM6A	P51674	278 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	UNC119	Q13432	240 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	OXA1L	Q15070	435 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	MPV17L	Q2QL34	196 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	ACTBL2	Q562R1	376 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	BEX5	Q5H9J7	111 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139		Q6ZVQ6	151 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	OSR2	Q8N2R0	312 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	NEUROG1	Q92886	237 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	YIPF5	Q969M3	257 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	RNF170	Q96K19	258 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	SPACA5	Q96QH8	159 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	GAL3ST1	Q99999	423 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	CACNA1C	Q13936	2221 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139		H7C417	338 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	ABCD4	O14678	606 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	LYRM1	O43325	122 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM157C	P0CG43	387 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	SERPINA2	P20848	420 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	RCVRN	P35243	200 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	CD200	P41217	278 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	VEGFC	P49767	419 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	EFNB2	P52799	333 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	DSCR9	P59020	149 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	TAS2R19	P59542	299 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	FGF12	P61328	243 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	IFITM3	Q01628	133 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	BSPH1	Q075Z2	132 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		5.8	□□□□□ -1.48

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