RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566452.1

BBS2-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 2

Gene BBS2, Length 299 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-215	ENST00000566452	MRAP2	Q96G30	205 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	KCNS1	Q96KK3	526 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	TMEM243	Q9BU79	118 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	NANOG	Q9H9S0	305 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	TLCD2	A6NGC4	264 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452		M0QYV0	167 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	ATP8B1	O43520	1251 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	NDUFS5	O43920	106 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	UGT2B11	O75310	529 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CA11	O75493	328 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	TG	P01266	2768 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	IGLV1-47	P01700	117 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	OCM2	P0CE71	109 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	PSMB9	P28065	219 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	GCLM	P48507	274 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF136	P52737	540 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CRISP3	P54108	245 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	BAX	Q07812	192 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	PNOC	Q13519	176 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF774	Q6NX45	483 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	OPN5	Q6U736	354 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	DRAM2	Q6UX65	266 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452		Q6ZR54	194 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	ITFG2	Q969R8	447 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	SNF8	Q96H20	258 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	OR10C1	Q96KK4	312 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	FAM210A	Q96ND0	272 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	BIRC8	Q96P09	236 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	METTL26	Q96S19	204 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	NOX3	Q9HBY0	568 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	DIABLO	Q9NR28	239 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CISH	Q9NSE2	258 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	ABCA1	O95477	2261 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	MED12	Q93074	2177 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452		A6NDX4	124 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452		J3QLI3	93 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	MANBA	O00462	879 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	SYNGR1	O43759	233 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	IGKV1D-16	P01601	117 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	UQCRH	P07919	91 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	NEFH	P12036	1026 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	HLA-DMA	P28067	261 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	PRSS3	P35030	304 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	SLC18A1	P54219	525 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	GNB2	P62879	340 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CDK5	Q00535	292 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	GNA12	Q03113	381 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	BNIP2	Q12982	314 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	PMVK	Q15126	192 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF429	Q86V71	674 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	MDP1	Q86V88	176 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	DEFB106A	Q8N104	65 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452		Q8N9W7	124 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		2.54	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms