RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561514.1

PALB2-202, Transcript of partner and localizer of BRCA2, humanhuman

TSL 5

Gene PALB2, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2-202ENST00000561514 DHRS3O75911 302 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 KDM4BO94953 1096 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 TTRP02766 147 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 TK1P04183 234 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 CD28P10747 220 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 OSMP13725 252 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 CCL3L1P16619 93 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 FAHP16930 419 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 PLA1AQ53H76 456 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 TCF23Q7RTU1 214 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 ZNF573Q86YE8 665 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 CPOQ8IVL8 374 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 LAX1Q8IWV1 398 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 ZNF679Q8IYX0 411 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 BEST4Q8NFU0 473 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 OR56B4Q8NH76 319 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 CNIH3Q8TBE1 160 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 OR51E1Q8TCB6 317 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 THEM6Q8WUY1 208 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 CORO2AQ92828 525 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 OR4F4Q96R69 305 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 TEAD3Q99594 435 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 SEC11CQ9BY50 192 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 GABARAPL3Q9BY60 117 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 PBOV1Q9GZY1 135 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 OR51E2Q9H255 320 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.76□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 A0A087X0M5 115 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 A0A1B0GTI1 187 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 A0A1B0GX30 115 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 DLEU1O43261 78 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 NRASP01111 189 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 CD2P06729 351 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 CCL1P22362 96 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 COX7A1P24310 79 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 CDKN1BP46527 198 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 CEBPGP53567 150 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 HCCSP53701 268 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 PRR20EP86478 221 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 PRR20CP86479 221 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 PRR20DP86480 221 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 PRR20BP86481 221 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 PRR20AP86496 221 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 TNFRSF9Q07011 255 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 IL24Q13007 206 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 C9orf152Q5JTZ5 239 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 PLCXD3Q63HM9 321 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 OR2T27Q8NH04 317 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 MRAPQ8TCY5 172 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 RPS4Y2Q8TD47 263 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 SLAMF9Q96A28 289 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 CXorf58Q96LI9 332 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 ZNF488Q96MN9 340 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 S100A13Q99584 98 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 MGLLQ99685 303 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 PKIBQ9C010 78 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 ISYNA1Q9NPH2 558 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 V9GYS6 101 aa6.75□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 IRGMA1A4Y4 181 aa6.74□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 SMLR1H3BR10 107 aa6.74□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 NXPH2O95156 264 aa6.74□□□□□ -1.33
PALB2-202ENST00000561514 ALDOBP05062 364 aa6.74□□□□□ -1.33
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