RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 LYPD2Q6UXB3 125 aa14.77□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRTM2Q8N967 370 aa14.77□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPOCK3Q9BQ16 436 aa14.77□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 TOLLIPQ9H0E2 274 aa14.77□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 DSCAML1Q8TD84 2053 aa14.77□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 L7N2F9 121 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADAM20O43506 726 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 MPC2O95563 127 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 PSMB6P28072 239 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 HTD2P86397 168 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM268Q5VZI3 342 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 AKR1E2Q96JD6 320 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR2D2Q9H210 308 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLA2Q9H6Q3 261 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 CALYQ9NYX4 217 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 LAMP3Q9UQV4 416 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 RP2O75695 350 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 CGB3P0DN86 165 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 CGB7P0DN87 165 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 F2RP25116 425 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 C17orf58Q2M2W7 97 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF546Q86UE3 836 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 DRAM1Q8N682 238 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC35G3Q8N808 338 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 GON7Q9BXV9 100 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 UBTD1Q9HAC8 227 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 GNG12Q9UBI6 72 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 NDUFA2O43678 99 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC25A4P12235 298 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 TCF23Q7RTU1 214 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF695Q8IW36 515 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 THAP6Q8TBB0 222 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 MBD2Q9UBB5 411 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 KAAG1Q9UBP8 84 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRBAP50851 2863 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 H0Y980 276 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 FCN3O75636 299 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGHV3-7P01780 117 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 UCP1P25874 307 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 SRPXP78539 464 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAB32Q13637 225 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF645Q8N7E2 425 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM56Q96MV1 263 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 MFFQ9GZY8 342 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 PSG11Q9UQ72 335 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARID1AO14497 2285 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 F2RL2O00254 374 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 RGS13O14921 159 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 ST8SIA5O15466 376 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 LY6HO94772 140 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 IL15RAQ13261 267 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 OPCMLQ14982 345 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 MORN2Q502X0 79 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMUB2Q71RG4 321 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 C5orf30Q96GV9 206 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 ABHD14BQ96IU4 210 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNF126Q9BV68 326 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 JPT1Q9UK76 154 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 FLNCQ14315 2725 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 H0YIZ8 118 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCNAB3O43448 404 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 NDUFB3O43676 98 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDS2O95674 445 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 LOXL3P58215 753 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 S100A10P60903 97 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 UTF1Q5T230 341 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM65Q6PI78 240 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 FOXRED2Q8IWF2 684 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 C19orf12Q9NSK7 152 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 CTSZQ9UBR2 303 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLN8Q9UBY8 286 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 RPA2P15927 270 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRRC10Q5BKY1 277 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 BTNL3Q6UXE8 466 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 CORO2AQ92828 525 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 LEAP2Q969E1 77 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 TNFSF18Q9UNG2 199 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 hADV38S2A0JD32 116 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 DVL1O14640 695 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 YPEL1O60688 119 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 SCGB1D2O95969 90 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGHV2-70P01814 119 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms