RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550379.1

RNF41-208, Transcript of ring finger protein 41, human

TSL 3

Gene RNF41, Length 525 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF41-208	ENST00000550379	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	GALNT14	Q96FL9	552 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	CYYR1	Q96J86	154 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	TMEM160	Q9NX00	188 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	OR5H14	A6NHG9	310 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	ODF3B	A8MYP8	253 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	LY6L	H3BQJ8	138 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	RAB29	O14966	203 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	TXNL1	O43396	289 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	IGLV2-14	P01704	120 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	FGF2	P09038	288 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	GNRHR	P30968	328 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	CEACAM6	P40199	344 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	UBE2E1	P51965	193 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	TSPAN5	P62079	268 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	CARTPT	Q16568	116 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	AANAT	Q16613	207 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	MIDN	Q504T8	468 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	PLET1	Q6UQ28	207 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	FGFRL1	Q8N441	504 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	CCDC107	Q8WV48	283 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	TMEM186	Q96B77	213 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379		Q96MF0	132 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	GINS4	Q9BRT9	223 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	OCEL1	Q9H607	264 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	RDH8	Q9NYR8	311 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	PSG11	Q9UQ72	335 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF41-208	ENST00000550379	ZAN	Q9Y493	2812 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379		A0A0B4J2A0	478 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	C7orf66	A4D0T2	115 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379		J3QR06	171 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379		M0QYG6	137 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	HSPA12A	O43301	675 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	PROP1	O75360	226 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	PEX14	O75381	377 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	MMP23A	O75900	390 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	FSHB	P01225	129 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	PMP2	P02689	132 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	CCL3L1	P16619	93 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	HLA-G	P17693	338 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF134	P52741	427 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	PRRX1	P54821	245 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	TAS2R31	P59538	309 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	HCP5	Q6MZN7	132 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379		Q6ZNX1	250 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	LRTM2	Q8N967	370 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	MMP28	Q9H239	520 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		6.27	□□□□□ -1.41

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