RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 SLC6A1P30531 599 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRB-204ENST00000538708 MMP16P51512 607 aa8.14□□□□□ -1.11
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PTPRB-204ENST00000538708 CD1BP29016 333 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-204ENST00000538708 SPCS3P61009 180 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-204ENST00000538708 B2MP61769 119 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-204ENST00000538708 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-204ENST00000538708 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-204ENST00000538708 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
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