RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COL12A1Q99715 3063 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NUDT15Q9NV35 164 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF221Q9UK13 617 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.97□□□□□ -1.29
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 USF3Q68DE3 2245 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC31A2O15432 143 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AKR1C4P17516 323 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PI3P19957 117 aa6.96□□□□□ -1.3
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UCP3P55916 312 aa6.96□□□□□ -1.3
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.96□□□□□ -1.3
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LYG1Q8N1E2 194 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZDHHC22Q8N966 263 aa6.96□□□□□ -1.3
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR9G1Q8NH87 305 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.96□□□□□ -1.3
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BEX2Q9BXY8 128 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BEX1Q9HBH7 125 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPR132Q9UNW8 380 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VSIG4Q9Y279 399 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1W2PRD5 423 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1W2PRF3 423 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1W2PRM7 423 aa6.95□□□□□ -1.3
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ITGB1BP1O14713 200 aa6.95□□□□□ -1.3
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC22A5O76082 557 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DHFRP00374 187 aa6.95□□□□□ -1.3
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.95□□□□□ -1.3
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LHX4Q969G2 390 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AKR1E2Q96JD6 320 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TBX15Q96SF7 602 aa6.95□□□□□ -1.3
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.95□□□□□ -1.3
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SIRPDQ9H106 197 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR2D2Q9H210 308 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AUP1Q9Y679 476 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A087X0M5 115 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1B0GX30 115 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAB29O14966 203 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PEX14O75381 377 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARG1P05089 322 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GATA3P23771 443 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IL3RAP26951 378 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD34P28906 385 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PIGPP57054 158 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TAS2R31P59538 309 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KLRD1Q13241 179 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C11orf88Q6PI97 169 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.94□□□□□ -1.3
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